Protein–RNA interactions for Protein: O88532

Zfr, Zinc finger RNA-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZfrO88532 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZfrO88532 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ZfrO88532 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZfrO88532 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZfrO88532 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZfrO88532 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZfrO88532 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZfrO88532 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZfrO88532 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZfrO88532 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZfrO88532 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZfrO88532 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZfrO88532 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZfrO88532 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZfrO88532 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZfrO88532 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZfrO88532 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZfrO88532 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZfrO88532 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZfrO88532 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZfrO88532 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZfrO88532 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZfrO88532 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZfrO88532 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ZfrO88532 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZfrO88532 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZfrO88532 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZfrO88532 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZfrO88532 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZfrO88532 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ZfrO88532 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZfrO88532 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZfrO88532 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZfrO88532 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZfrO88532 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZfrO88532 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZfrO88532 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZfrO88532 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZfrO88532 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZfrO88532 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZfrO88532 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZfrO88532 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZfrO88532 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZfrO88532 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZfrO88532 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZfrO88532 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZfrO88532 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZfrO88532 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZfrO88532 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ZfrO88532 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZfrO88532 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZfrO88532 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZfrO88532 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZfrO88532 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZfrO88532 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZfrO88532 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ZfrO88532 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZfrO88532 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZfrO88532 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZfrO88532 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZfrO88532 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZfrO88532 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZfrO88532 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
ZfrO88532 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZfrO88532 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZfrO88532 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZfrO88532 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZfrO88532 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZfrO88532 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZfrO88532 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ZfrO88532 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZfrO88532 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZfrO88532 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZfrO88532 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZfrO88532 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZfrO88532 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZfrO88532 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZfrO88532 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ZfrO88532 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZfrO88532 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZfrO88532 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZfrO88532 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ZfrO88532 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZfrO88532 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZfrO88532 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZfrO88532 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZfrO88532 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZfrO88532 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZfrO88532 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZfrO88532 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZfrO88532 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZfrO88532 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZfrO88532 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ZfrO88532 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZfrO88532 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZfrO88532 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZfrO88532 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZfrO88532 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZfrO88532 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZfrO88532 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 205.4 ms