Protein–RNA interactions for Protein: O55106

Strn, Striatin, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StrnO55106 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
StrnO55106 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
StrnO55106 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
StrnO55106 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
StrnO55106 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
StrnO55106 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
StrnO55106 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
StrnO55106 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
StrnO55106 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
StrnO55106 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
StrnO55106 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
StrnO55106 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
StrnO55106 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
StrnO55106 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
StrnO55106 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
StrnO55106 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
StrnO55106 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
StrnO55106 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
StrnO55106 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
StrnO55106 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
StrnO55106 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
StrnO55106 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
StrnO55106 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
StrnO55106 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
StrnO55106 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
StrnO55106 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
StrnO55106 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
StrnO55106 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
StrnO55106 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
StrnO55106 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
StrnO55106 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
StrnO55106 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
StrnO55106 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
StrnO55106 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
StrnO55106 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
StrnO55106 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
StrnO55106 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
StrnO55106 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
StrnO55106 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
StrnO55106 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
StrnO55106 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
StrnO55106 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
StrnO55106 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
StrnO55106 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
StrnO55106 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
StrnO55106 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
StrnO55106 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
StrnO55106 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
StrnO55106 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
StrnO55106 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
StrnO55106 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
StrnO55106 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
StrnO55106 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
StrnO55106 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
StrnO55106 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
StrnO55106 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
StrnO55106 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
StrnO55106 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
StrnO55106 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
StrnO55106 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
StrnO55106 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
StrnO55106 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
StrnO55106 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
StrnO55106 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
StrnO55106 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
StrnO55106 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
StrnO55106 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
StrnO55106 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
StrnO55106 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
StrnO55106 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
StrnO55106 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
StrnO55106 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
StrnO55106 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
StrnO55106 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
StrnO55106 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
StrnO55106 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
StrnO55106 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
StrnO55106 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
StrnO55106 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
StrnO55106 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
StrnO55106 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
StrnO55106 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
StrnO55106 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
StrnO55106 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
StrnO55106 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
StrnO55106 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
StrnO55106 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
StrnO55106 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
StrnO55106 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
StrnO55106 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
StrnO55106 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
StrnO55106 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
StrnO55106 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
StrnO55106 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
StrnO55106 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
StrnO55106 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
StrnO55106 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
StrnO55106 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
StrnO55106 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
StrnO55106 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms