Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Copb2O55029 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Copb2O55029 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Copb2O55029 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Copb2O55029 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Copb2O55029 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Copb2O55029 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Copb2O55029 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Copb2O55029 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Copb2O55029 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Copb2O55029 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Copb2O55029 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Copb2O55029 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Copb2O55029 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Copb2O55029 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Copb2O55029 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Copb2O55029 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Copb2O55029 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Copb2O55029 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Copb2O55029 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Copb2O55029 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Copb2O55029 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Copb2O55029 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Copb2O55029 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Copb2O55029 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Copb2O55029 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Copb2O55029 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Copb2O55029 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Copb2O55029 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Copb2O55029 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Copb2O55029 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Copb2O55029 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Copb2O55029 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Copb2O55029 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Copb2O55029 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Copb2O55029 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Copb2O55029 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Copb2O55029 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Copb2O55029 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Copb2O55029 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Copb2O55029 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Copb2O55029 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Copb2O55029 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Copb2O55029 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Copb2O55029 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Copb2O55029 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Copb2O55029 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Copb2O55029 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Copb2O55029 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Copb2O55029 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Copb2O55029 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Copb2O55029 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Copb2O55029 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Copb2O55029 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Copb2O55029 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Copb2O55029 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Copb2O55029 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Copb2O55029 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Copb2O55029 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Copb2O55029 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Copb2O55029 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Copb2O55029 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Copb2O55029 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Copb2O55029 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Copb2O55029 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Copb2O55029 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Copb2O55029 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Copb2O55029 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Copb2O55029 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Copb2O55029 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Copb2O55029 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Copb2O55029 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Copb2O55029 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Copb2O55029 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Copb2O55029 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Copb2O55029 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Copb2O55029 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Copb2O55029 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Copb2O55029 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Copb2O55029 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Copb2O55029 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Copb2O55029 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Copb2O55029 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Copb2O55029 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Copb2O55029 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Copb2O55029 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Copb2O55029 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Copb2O55029 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Copb2O55029 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Copb2O55029 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Copb2O55029 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Copb2O55029 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Copb2O55029 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Copb2O55029 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Copb2O55029 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Copb2O55029 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Copb2O55029 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Copb2O55029 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Copb2O55029 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Copb2O55029 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.6 ms