Protein–RNA interactions for Protein: O54818

Tpd52l1, Tumor protein D53, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpd52l1O54818 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tpd52l1O54818 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tpd52l1O54818 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tpd52l1O54818 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tpd52l1O54818 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tpd52l1O54818 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tpd52l1O54818 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tpd52l1O54818 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tpd52l1O54818 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tpd52l1O54818 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tpd52l1O54818 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tpd52l1O54818 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tpd52l1O54818 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Tpd52l1O54818 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tpd52l1O54818 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tpd52l1O54818 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tpd52l1O54818 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tpd52l1O54818 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tpd52l1O54818 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tpd52l1O54818 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tpd52l1O54818 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tpd52l1O54818 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tpd52l1O54818 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tpd52l1O54818 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tpd52l1O54818 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tpd52l1O54818 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tpd52l1O54818 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tpd52l1O54818 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tpd52l1O54818 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tpd52l1O54818 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Tpd52l1O54818 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tpd52l1O54818 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tpd52l1O54818 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tpd52l1O54818 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tpd52l1O54818 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tpd52l1O54818 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tpd52l1O54818 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tpd52l1O54818 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tpd52l1O54818 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tpd52l1O54818 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tpd52l1O54818 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tpd52l1O54818 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Tpd52l1O54818 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tpd52l1O54818 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tpd52l1O54818 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Tpd52l1O54818 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tpd52l1O54818 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tpd52l1O54818 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tpd52l1O54818 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tpd52l1O54818 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tpd52l1O54818 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tpd52l1O54818 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tpd52l1O54818 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tpd52l1O54818 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tpd52l1O54818 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tpd52l1O54818 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tpd52l1O54818 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tpd52l1O54818 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tpd52l1O54818 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tpd52l1O54818 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Tpd52l1O54818 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tpd52l1O54818 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tpd52l1O54818 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tpd52l1O54818 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tpd52l1O54818 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tpd52l1O54818 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tpd52l1O54818 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tpd52l1O54818 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tpd52l1O54818 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tpd52l1O54818 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tpd52l1O54818 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tpd52l1O54818 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tpd52l1O54818 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tpd52l1O54818 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tpd52l1O54818 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tpd52l1O54818 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tpd52l1O54818 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tpd52l1O54818 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tpd52l1O54818 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tpd52l1O54818 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tpd52l1O54818 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Tpd52l1O54818 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Tpd52l1O54818 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tpd52l1O54818 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tpd52l1O54818 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tpd52l1O54818 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tpd52l1O54818 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tpd52l1O54818 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tpd52l1O54818 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tpd52l1O54818 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tpd52l1O54818 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tpd52l1O54818 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tpd52l1O54818 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tpd52l1O54818 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tpd52l1O54818 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tpd52l1O54818 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tpd52l1O54818 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tpd52l1O54818 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tpd52l1O54818 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tpd52l1O54818 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms