Protein–RNA interactions for Protein: O54792

Hes2, Transcription factor HES-2, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hes2O54792 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hes2O54792 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hes2O54792 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hes2O54792 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Hes2O54792 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hes2O54792 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Hes2O54792 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hes2O54792 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hes2O54792 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hes2O54792 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hes2O54792 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hes2O54792 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hes2O54792 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hes2O54792 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hes2O54792 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hes2O54792 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hes2O54792 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hes2O54792 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hes2O54792 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hes2O54792 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hes2O54792 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hes2O54792 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hes2O54792 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hes2O54792 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hes2O54792 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hes2O54792 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hes2O54792 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hes2O54792 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.35
Hes2O54792 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Hes2O54792 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hes2O54792 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hes2O54792 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hes2O54792 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hes2O54792 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hes2O54792 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hes2O54792 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hes2O54792 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hes2O54792 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hes2O54792 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hes2O54792 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hes2O54792 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hes2O54792 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hes2O54792 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Hes2O54792 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hes2O54792 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hes2O54792 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hes2O54792 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hes2O54792 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hes2O54792 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hes2O54792 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hes2O54792 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hes2O54792 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hes2O54792 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hes2O54792 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hes2O54792 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hes2O54792 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hes2O54792 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hes2O54792 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hes2O54792 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hes2O54792 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hes2O54792 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hes2O54792 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hes2O54792 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hes2O54792 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hes2O54792 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hes2O54792 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hes2O54792 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hes2O54792 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hes2O54792 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hes2O54792 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hes2O54792 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Hes2O54792 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Hes2O54792 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hes2O54792 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hes2O54792 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Hes2O54792 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Hes2O54792 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hes2O54792 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hes2O54792 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hes2O54792 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hes2O54792 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hes2O54792 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hes2O54792 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hes2O54792 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hes2O54792 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hes2O54792 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hes2O54792 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hes2O54792 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hes2O54792 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hes2O54792 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hes2O54792 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hes2O54792 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hes2O54792 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hes2O54792 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hes2O54792 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hes2O54792 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hes2O54792 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hes2O54792 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hes2O54792 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hes2O54792 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms