Protein–RNA interactions for Protein: O35652

Lhx8, LIM/homeobox protein Lhx8, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx8O35652 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lhx8O35652 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lhx8O35652 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lhx8O35652 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lhx8O35652 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lhx8O35652 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lhx8O35652 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lhx8O35652 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lhx8O35652 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lhx8O35652 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lhx8O35652 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lhx8O35652 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lhx8O35652 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lhx8O35652 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lhx8O35652 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lhx8O35652 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lhx8O35652 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lhx8O35652 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lhx8O35652 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lhx8O35652 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lhx8O35652 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lhx8O35652 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lhx8O35652 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lhx8O35652 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lhx8O35652 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lhx8O35652 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Lhx8O35652 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Lhx8O35652 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lhx8O35652 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lhx8O35652 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lhx8O35652 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lhx8O35652 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lhx8O35652 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lhx8O35652 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lhx8O35652 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lhx8O35652 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lhx8O35652 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lhx8O35652 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lhx8O35652 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lhx8O35652 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lhx8O35652 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lhx8O35652 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lhx8O35652 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lhx8O35652 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lhx8O35652 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lhx8O35652 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lhx8O35652 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lhx8O35652 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lhx8O35652 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lhx8O35652 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lhx8O35652 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lhx8O35652 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Lhx8O35652 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lhx8O35652 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lhx8O35652 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lhx8O35652 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lhx8O35652 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lhx8O35652 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lhx8O35652 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lhx8O35652 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lhx8O35652 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lhx8O35652 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lhx8O35652 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lhx8O35652 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lhx8O35652 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lhx8O35652 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lhx8O35652 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lhx8O35652 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lhx8O35652 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lhx8O35652 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lhx8O35652 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lhx8O35652 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Lhx8O35652 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Lhx8O35652 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lhx8O35652 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lhx8O35652 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lhx8O35652 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Lhx8O35652 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lhx8O35652 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lhx8O35652 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lhx8O35652 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lhx8O35652 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lhx8O35652 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lhx8O35652 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lhx8O35652 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lhx8O35652 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Lhx8O35652 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lhx8O35652 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lhx8O35652 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lhx8O35652 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Lhx8O35652 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lhx8O35652 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lhx8O35652 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Lhx8O35652 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lhx8O35652 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lhx8O35652 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lhx8O35652 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lhx8O35652 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lhx8O35652 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lhx8O35652 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms