Protein–RNA interactions for Protein: O35602

Rax, Retinal homeobox protein Rx, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RaxO35602 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RaxO35602 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RaxO35602 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RaxO35602 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RaxO35602 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RaxO35602 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RaxO35602 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RaxO35602 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RaxO35602 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RaxO35602 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RaxO35602 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RaxO35602 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RaxO35602 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RaxO35602 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RaxO35602 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RaxO35602 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RaxO35602 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RaxO35602 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RaxO35602 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RaxO35602 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RaxO35602 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RaxO35602 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RaxO35602 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RaxO35602 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RaxO35602 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RaxO35602 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RaxO35602 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RaxO35602 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RaxO35602 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RaxO35602 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RaxO35602 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RaxO35602 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RaxO35602 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RaxO35602 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RaxO35602 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RaxO35602 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RaxO35602 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RaxO35602 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RaxO35602 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RaxO35602 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RaxO35602 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RaxO35602 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RaxO35602 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RaxO35602 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RaxO35602 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RaxO35602 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RaxO35602 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RaxO35602 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RaxO35602 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RaxO35602 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RaxO35602 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RaxO35602 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RaxO35602 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RaxO35602 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RaxO35602 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RaxO35602 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RaxO35602 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RaxO35602 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RaxO35602 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RaxO35602 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RaxO35602 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RaxO35602 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RaxO35602 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RaxO35602 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RaxO35602 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RaxO35602 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RaxO35602 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RaxO35602 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RaxO35602 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RaxO35602 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RaxO35602 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RaxO35602 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RaxO35602 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RaxO35602 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RaxO35602 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RaxO35602 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RaxO35602 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RaxO35602 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RaxO35602 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RaxO35602 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RaxO35602 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RaxO35602 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RaxO35602 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RaxO35602 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RaxO35602 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RaxO35602 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RaxO35602 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RaxO35602 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RaxO35602 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RaxO35602 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RaxO35602 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RaxO35602 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RaxO35602 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RaxO35602 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RaxO35602 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RaxO35602 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RaxO35602 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RaxO35602 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RaxO35602 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RaxO35602 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms