Protein–RNA interactions for Protein: O08842

Gfra2, GDNF family receptor alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra2O08842 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gfra2O08842 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gfra2O08842 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gfra2O08842 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gfra2O08842 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gfra2O08842 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gfra2O08842 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gfra2O08842 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gfra2O08842 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gfra2O08842 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gfra2O08842 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gfra2O08842 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gfra2O08842 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gfra2O08842 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gfra2O08842 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gfra2O08842 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gfra2O08842 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gfra2O08842 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gfra2O08842 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gfra2O08842 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gfra2O08842 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gfra2O08842 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gfra2O08842 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gfra2O08842 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gfra2O08842 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gfra2O08842 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gfra2O08842 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gfra2O08842 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gfra2O08842 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gfra2O08842 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gfra2O08842 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Gfra2O08842 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gfra2O08842 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gfra2O08842 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gfra2O08842 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gfra2O08842 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gfra2O08842 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gfra2O08842 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Gfra2O08842 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gfra2O08842 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gfra2O08842 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gfra2O08842 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gfra2O08842 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gfra2O08842 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gfra2O08842 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gfra2O08842 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gfra2O08842 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gfra2O08842 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gfra2O08842 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gfra2O08842 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Gfra2O08842 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Gfra2O08842 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gfra2O08842 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gfra2O08842 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gfra2O08842 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gfra2O08842 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gfra2O08842 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gfra2O08842 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gfra2O08842 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gfra2O08842 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gfra2O08842 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gfra2O08842 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gfra2O08842 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gfra2O08842 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gfra2O08842 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gfra2O08842 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gfra2O08842 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gfra2O08842 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gfra2O08842 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gfra2O08842 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gfra2O08842 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Gfra2O08842 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gfra2O08842 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gfra2O08842 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gfra2O08842 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gfra2O08842 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Gfra2O08842 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gfra2O08842 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gfra2O08842 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gfra2O08842 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gfra2O08842 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Gfra2O08842 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gfra2O08842 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gfra2O08842 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gfra2O08842 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gfra2O08842 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gfra2O08842 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gfra2O08842 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gfra2O08842 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gfra2O08842 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gfra2O08842 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gfra2O08842 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gfra2O08842 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gfra2O08842 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gfra2O08842 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gfra2O08842 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gfra2O08842 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gfra2O08842 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gfra2O08842 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gfra2O08842 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.8 ms