Protein–RNA interactions for Protein: M0QW81

Gm3488, Predicted gene, 3488, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3488M0QW81 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm3488M0QW81 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm3488M0QW81 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm3488M0QW81 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm3488M0QW81 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm3488M0QW81 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm3488M0QW81 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm3488M0QW81 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm3488M0QW81 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm3488M0QW81 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm3488M0QW81 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm3488M0QW81 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm3488M0QW81 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm3488M0QW81 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm3488M0QW81 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm3488M0QW81 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm3488M0QW81 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm3488M0QW81 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm3488M0QW81 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm3488M0QW81 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm3488M0QW81 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm3488M0QW81 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm3488M0QW81 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm3488M0QW81 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm3488M0QW81 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm3488M0QW81 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm3488M0QW81 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm3488M0QW81 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm3488M0QW81 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm3488M0QW81 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm3488M0QW81 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm3488M0QW81 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm3488M0QW81 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm3488M0QW81 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm3488M0QW81 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm3488M0QW81 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm3488M0QW81 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm3488M0QW81 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm3488M0QW81 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm3488M0QW81 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm3488M0QW81 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm3488M0QW81 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm3488M0QW81 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm3488M0QW81 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm3488M0QW81 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm3488M0QW81 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm3488M0QW81 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm3488M0QW81 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm3488M0QW81 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm3488M0QW81 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm3488M0QW81 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm3488M0QW81 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm3488M0QW81 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm3488M0QW81 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm3488M0QW81 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm3488M0QW81 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm3488M0QW81 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gm3488M0QW81 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm3488M0QW81 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm3488M0QW81 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm3488M0QW81 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm3488M0QW81 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm3488M0QW81 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm3488M0QW81 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm3488M0QW81 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm3488M0QW81 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm3488M0QW81 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm3488M0QW81 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm3488M0QW81 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm3488M0QW81 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm3488M0QW81 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm3488M0QW81 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm3488M0QW81 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm3488M0QW81 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm3488M0QW81 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm3488M0QW81 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm3488M0QW81 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm3488M0QW81 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm3488M0QW81 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm3488M0QW81 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm3488M0QW81 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm3488M0QW81 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm3488M0QW81 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm3488M0QW81 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm3488M0QW81 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gm3488M0QW81 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm3488M0QW81 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm3488M0QW81 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm3488M0QW81 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm3488M0QW81 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm3488M0QW81 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm3488M0QW81 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm3488M0QW81 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm3488M0QW81 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm3488M0QW81 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm3488M0QW81 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm3488M0QW81 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm3488M0QW81 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm3488M0QW81 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm3488M0QW81 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
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