Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm21818J3KMS6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm21818J3KMS6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm21818J3KMS6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm21818J3KMS6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm21818J3KMS6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm21818J3KMS6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm21818J3KMS6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm21818J3KMS6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm21818J3KMS6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm21818J3KMS6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm21818J3KMS6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm21818J3KMS6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm21818J3KMS6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm21818J3KMS6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm21818J3KMS6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm21818J3KMS6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm21818J3KMS6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm21818J3KMS6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm21818J3KMS6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm21818J3KMS6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm21818J3KMS6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm21818J3KMS6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm21818J3KMS6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm21818J3KMS6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm21818J3KMS6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm21818J3KMS6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm21818J3KMS6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm21818J3KMS6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm21818J3KMS6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm21818J3KMS6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm21818J3KMS6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm21818J3KMS6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm21818J3KMS6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm21818J3KMS6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm21818J3KMS6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm21818J3KMS6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm21818J3KMS6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm21818J3KMS6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm21818J3KMS6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm21818J3KMS6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm21818J3KMS6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm21818J3KMS6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm21818J3KMS6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm21818J3KMS6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm21818J3KMS6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm21818J3KMS6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm21818J3KMS6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm21818J3KMS6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm21818J3KMS6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm21818J3KMS6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm21818J3KMS6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm21818J3KMS6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm21818J3KMS6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm21818J3KMS6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm21818J3KMS6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm21818J3KMS6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm21818J3KMS6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm21818J3KMS6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm21818J3KMS6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm21818J3KMS6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm21818J3KMS6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm21818J3KMS6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm21818J3KMS6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm21818J3KMS6 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm21818J3KMS6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm21818J3KMS6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm21818J3KMS6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm21818J3KMS6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm21818J3KMS6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm21818J3KMS6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm21818J3KMS6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm21818J3KMS6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm21818J3KMS6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm21818J3KMS6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm21818J3KMS6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm21818J3KMS6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm21818J3KMS6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm21818J3KMS6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm21818J3KMS6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm21818J3KMS6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm21818J3KMS6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm21818J3KMS6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm21818J3KMS6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm21818J3KMS6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm21818J3KMS6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm21818J3KMS6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm21818J3KMS6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm21818J3KMS6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm21818J3KMS6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm21818J3KMS6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm21818J3KMS6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm21818J3KMS6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm21818J3KMS6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm21818J3KMS6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm21818J3KMS6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm21818J3KMS6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm21818J3KMS6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm21818J3KMS6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm21818J3KMS6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.4 ms