Protein–RNA interactions for Protein: G5E861

Sclt1, Sodium channel and clathrin linker 1, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sclt1G5E861 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sclt1G5E861 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Sclt1G5E861 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Sclt1G5E861 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sclt1G5E861 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sclt1G5E861 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sclt1G5E861 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Sclt1G5E861 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Sclt1G5E861 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sclt1G5E861 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sclt1G5E861 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sclt1G5E861 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sclt1G5E861 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sclt1G5E861 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sclt1G5E861 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sclt1G5E861 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sclt1G5E861 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sclt1G5E861 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sclt1G5E861 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sclt1G5E861 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sclt1G5E861 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sclt1G5E861 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sclt1G5E861 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sclt1G5E861 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sclt1G5E861 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sclt1G5E861 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Sclt1G5E861 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sclt1G5E861 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sclt1G5E861 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sclt1G5E861 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sclt1G5E861 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sclt1G5E861 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sclt1G5E861 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sclt1G5E861 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sclt1G5E861 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sclt1G5E861 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sclt1G5E861 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sclt1G5E861 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sclt1G5E861 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Sclt1G5E861 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sclt1G5E861 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sclt1G5E861 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sclt1G5E861 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sclt1G5E861 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sclt1G5E861 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sclt1G5E861 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sclt1G5E861 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sclt1G5E861 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sclt1G5E861 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sclt1G5E861 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sclt1G5E861 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sclt1G5E861 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sclt1G5E861 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sclt1G5E861 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sclt1G5E861 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sclt1G5E861 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sclt1G5E861 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sclt1G5E861 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sclt1G5E861 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sclt1G5E861 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Sclt1G5E861 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sclt1G5E861 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Sclt1G5E861 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Sclt1G5E861 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sclt1G5E861 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sclt1G5E861 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sclt1G5E861 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Sclt1G5E861 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sclt1G5E861 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sclt1G5E861 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sclt1G5E861 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sclt1G5E861 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sclt1G5E861 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sclt1G5E861 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sclt1G5E861 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sclt1G5E861 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sclt1G5E861 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sclt1G5E861 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sclt1G5E861 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sclt1G5E861 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sclt1G5E861 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sclt1G5E861 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sclt1G5E861 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sclt1G5E861 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sclt1G5E861 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sclt1G5E861 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sclt1G5E861 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sclt1G5E861 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sclt1G5E861 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Sclt1G5E861 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sclt1G5E861 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sclt1G5E861 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Sclt1G5E861 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sclt1G5E861 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sclt1G5E861 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sclt1G5E861 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Sclt1G5E861 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sclt1G5E861 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sclt1G5E861 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sclt1G5E861 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms