Protein–RNA interactions for Protein: G3X9F6

Sh3tc1, SH3 domain and tetratricopeptide repeats 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3tc1G3X9F6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Sh3tc1G3X9F6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Sh3tc1G3X9F6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Sh3tc1G3X9F6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Sh3tc1G3X9F6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Sh3tc1G3X9F6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Sh3tc1G3X9F6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Sh3tc1G3X9F6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Sh3tc1G3X9F6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Sh3tc1G3X9F6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Sh3tc1G3X9F6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Sh3tc1G3X9F6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Sh3tc1G3X9F6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Sh3tc1G3X9F6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Sh3tc1G3X9F6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Sh3tc1G3X9F6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Sh3tc1G3X9F6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Sh3tc1G3X9F6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Sh3tc1G3X9F6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Sh3tc1G3X9F6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Sh3tc1G3X9F6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Sh3tc1G3X9F6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Sh3tc1G3X9F6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Sh3tc1G3X9F6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Sh3tc1G3X9F6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Sh3tc1G3X9F6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Sh3tc1G3X9F6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Sh3tc1G3X9F6 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
Sh3tc1G3X9F6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Sh3tc1G3X9F6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Sh3tc1G3X9F6 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Sh3tc1G3X9F6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Sh3tc1G3X9F6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Sh3tc1G3X9F6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Sh3tc1G3X9F6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sh3tc1G3X9F6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sh3tc1G3X9F6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sh3tc1G3X9F6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sh3tc1G3X9F6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sh3tc1G3X9F6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sh3tc1G3X9F6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Sh3tc1G3X9F6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Sh3tc1G3X9F6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Sh3tc1G3X9F6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Sh3tc1G3X9F6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Sh3tc1G3X9F6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Sh3tc1G3X9F6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Sh3tc1G3X9F6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Sh3tc1G3X9F6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Sh3tc1G3X9F6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Sh3tc1G3X9F6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Sh3tc1G3X9F6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Sh3tc1G3X9F6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Sh3tc1G3X9F6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Sh3tc1G3X9F6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Sh3tc1G3X9F6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Sh3tc1G3X9F6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Sh3tc1G3X9F6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Sh3tc1G3X9F6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Sh3tc1G3X9F6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sh3tc1G3X9F6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sh3tc1G3X9F6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sh3tc1G3X9F6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sh3tc1G3X9F6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Sh3tc1G3X9F6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Sh3tc1G3X9F6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Sh3tc1G3X9F6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Sh3tc1G3X9F6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Sh3tc1G3X9F6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Sh3tc1G3X9F6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sh3tc1G3X9F6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sh3tc1G3X9F6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sh3tc1G3X9F6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Sh3tc1G3X9F6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Sh3tc1G3X9F6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Sh3tc1G3X9F6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Sh3tc1G3X9F6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Sh3tc1G3X9F6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Sh3tc1G3X9F6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Sh3tc1G3X9F6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Sh3tc1G3X9F6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Sh3tc1G3X9F6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Sh3tc1G3X9F6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Sh3tc1G3X9F6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.55■■■□□ 2
Sh3tc1G3X9F6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Sh3tc1G3X9F6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Sh3tc1G3X9F6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Sh3tc1G3X9F6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Sh3tc1G3X9F6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Sh3tc1G3X9F6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Sh3tc1G3X9F6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Sh3tc1G3X9F6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Sh3tc1G3X9F6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Sh3tc1G3X9F6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Sh3tc1G3X9F6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Sh3tc1G3X9F6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Sh3tc1G3X9F6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Sh3tc1G3X9F6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Sh3tc1G3X9F6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Sh3tc1G3X9F6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms