Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4Y3

4930546C10Rik, RIKEN cDNA 4930546C10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930546C10RikE9Q4Y3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC15,58■□□□□ 0,08
4930546C10RikE9Q4Y3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15,58■□□□□ 0,08
4930546C10RikE9Q4Y3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15,57■□□□□ 0,08
4930546C10RikE9Q4Y3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15,57■□□□□ 0,08
4930546C10RikE9Q4Y3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,57■□□□□ 0,08
4930546C10RikE9Q4Y3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC15,57■□□□□ 0,08
4930546C10RikE9Q4Y3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15,57■□□□□ 0,08
4930546C10RikE9Q4Y3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,57■□□□□ 0,08
4930546C10RikE9Q4Y3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC15,57■□□□□ 0,08
4930546C10RikE9Q4Y3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,56■□□□□ 0,08
4930546C10RikE9Q4Y3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15,56■□□□□ 0,08
4930546C10RikE9Q4Y3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,56■□□□□ 0,08
4930546C10RikE9Q4Y3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC15,56■□□□□ 0,08
4930546C10RikE9Q4Y3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC15,56■□□□□ 0,08
4930546C10RikE9Q4Y3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15,56■□□□□ 0,08
4930546C10RikE9Q4Y3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15,56■□□□□ 0,08
4930546C10RikE9Q4Y3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15,56■□□□□ 0,08
4930546C10RikE9Q4Y3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15,56■□□□□ 0,08
4930546C10RikE9Q4Y3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15,56■□□□□ 0,08
4930546C10RikE9Q4Y3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,56■□□□□ 0,08
4930546C10RikE9Q4Y3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15,56■□□□□ 0,08
4930546C10RikE9Q4Y3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15,56■□□□□ 0,08
4930546C10RikE9Q4Y3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15,56■□□□□ 0,08
4930546C10RikE9Q4Y3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15,56■□□□□ 0,08
4930546C10RikE9Q4Y3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,55■□□□□ 0,08
4930546C10RikE9Q4Y3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,55■□□□□ 0,08
4930546C10RikE9Q4Y3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15,55■□□□□ 0,08
4930546C10RikE9Q4Y3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15,55■□□□□ 0,08
4930546C10RikE9Q4Y3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC15,55■□□□□ 0,08
4930546C10RikE9Q4Y3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,55■□□□□ 0,08
4930546C10RikE9Q4Y3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15,55■□□□□ 0,08
4930546C10RikE9Q4Y3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,54■□□□□ 0,08
4930546C10RikE9Q4Y3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC15,54■□□□□ 0,08
4930546C10RikE9Q4Y3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15,54■□□□□ 0,08
4930546C10RikE9Q4Y3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,54■□□□□ 0,08
4930546C10RikE9Q4Y3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC15,54■□□□□ 0,08
4930546C10RikE9Q4Y3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15,54■□□□□ 0,08
4930546C10RikE9Q4Y3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,54■□□□□ 0,08
4930546C10RikE9Q4Y3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC15,54■□□□□ 0,08
4930546C10RikE9Q4Y3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC15,54■□□□□ 0,08
4930546C10RikE9Q4Y3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15,54■□□□□ 0,08
4930546C10RikE9Q4Y3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15,53■□□□□ 0,08
4930546C10RikE9Q4Y3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15,53■□□□□ 0,08
4930546C10RikE9Q4Y3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,53■□□□□ 0,08
4930546C10RikE9Q4Y3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,53■□□□□ 0,08
4930546C10RikE9Q4Y3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC15,53■□□□□ 0,08
4930546C10RikE9Q4Y3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,53■□□□□ 0,08
4930546C10RikE9Q4Y3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15,53■□□□□ 0,08
4930546C10RikE9Q4Y3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC15,53■□□□□ 0,08
4930546C10RikE9Q4Y3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15,53■□□□□ 0,08
4930546C10RikE9Q4Y3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,52■□□□□ 0,08
4930546C10RikE9Q4Y3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,52■□□□□ 0,08
4930546C10RikE9Q4Y3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,52■□□□□ 0,08
4930546C10RikE9Q4Y3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,52■□□□□ 0,08
4930546C10RikE9Q4Y3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15,52■□□□□ 0,07
4930546C10RikE9Q4Y3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15,52■□□□□ 0,07
4930546C10RikE9Q4Y3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15,52■□□□□ 0,07
4930546C10RikE9Q4Y3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC15,51■□□□□ 0,07
4930546C10RikE9Q4Y3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,51■□□□□ 0,07
4930546C10RikE9Q4Y3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,51■□□□□ 0,07
4930546C10RikE9Q4Y3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,51■□□□□ 0,07
4930546C10RikE9Q4Y3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,51■□□□□ 0,07
4930546C10RikE9Q4Y3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15,51■□□□□ 0,07
4930546C10RikE9Q4Y3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15,51■□□□□ 0,07
4930546C10RikE9Q4Y3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC15,51■□□□□ 0,07
4930546C10RikE9Q4Y3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,5■□□□□ 0,07
4930546C10RikE9Q4Y3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15,5■□□□□ 0,07
4930546C10RikE9Q4Y3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,5■□□□□ 0,07
4930546C10RikE9Q4Y3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC15,5■□□□□ 0,07
4930546C10RikE9Q4Y3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15,5■□□□□ 0,07
4930546C10RikE9Q4Y3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15,5■□□□□ 0,07
4930546C10RikE9Q4Y3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,5■□□□□ 0,07
4930546C10RikE9Q4Y3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15,49■□□□□ 0,07
4930546C10RikE9Q4Y3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15,49■□□□□ 0,07
4930546C10RikE9Q4Y3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,49■□□□□ 0,07
4930546C10RikE9Q4Y3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15,49■□□□□ 0,07
4930546C10RikE9Q4Y3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,49■□□□□ 0,07
4930546C10RikE9Q4Y3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,49■□□□□ 0,07
4930546C10RikE9Q4Y3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,49■□□□□ 0,07
4930546C10RikE9Q4Y3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15,49■□□□□ 0,07
4930546C10RikE9Q4Y3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,48■□□□□ 0,07
4930546C10RikE9Q4Y3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,48■□□□□ 0,07
4930546C10RikE9Q4Y3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC15,47■□□□□ 0,07
4930546C10RikE9Q4Y3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,47■□□□□ 0,07
4930546C10RikE9Q4Y3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,47■□□□□ 0,07
4930546C10RikE9Q4Y3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15,47■□□□□ 0,07
4930546C10RikE9Q4Y3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15,47■□□□□ 0,07
4930546C10RikE9Q4Y3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC15,47■□□□□ 0,07
4930546C10RikE9Q4Y3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15,47■□□□□ 0,07
4930546C10RikE9Q4Y3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,46■□□□□ 0,07
4930546C10RikE9Q4Y3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,46■□□□□ 0,07
4930546C10RikE9Q4Y3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15,46■□□□□ 0,07
4930546C10RikE9Q4Y3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC15,46■□□□□ 0,07
4930546C10RikE9Q4Y3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC15,46■□□□□ 0,07
4930546C10RikE9Q4Y3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,46■□□□□ 0,07
4930546C10RikE9Q4Y3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,46■□□□□ 0,07
4930546C10RikE9Q4Y3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15,45■□□□□ 0,06
4930546C10RikE9Q4Y3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15,45■□□□□ 0,06
4930546C10RikE9Q4Y3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,45■□□□□ 0,06
4930546C10RikE9Q4Y3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,45■□□□□ 0,06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19,5 ms