Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2R5

Selenon, Selenoprotein N, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenonD3Z2R5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SelenonD3Z2R5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SelenonD3Z2R5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SelenonD3Z2R5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SelenonD3Z2R5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SelenonD3Z2R5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SelenonD3Z2R5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SelenonD3Z2R5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SelenonD3Z2R5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SelenonD3Z2R5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SelenonD3Z2R5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SelenonD3Z2R5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SelenonD3Z2R5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SelenonD3Z2R5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SelenonD3Z2R5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SelenonD3Z2R5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SelenonD3Z2R5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SelenonD3Z2R5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SelenonD3Z2R5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SelenonD3Z2R5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SelenonD3Z2R5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SelenonD3Z2R5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SelenonD3Z2R5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SelenonD3Z2R5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SelenonD3Z2R5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SelenonD3Z2R5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SelenonD3Z2R5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SelenonD3Z2R5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SelenonD3Z2R5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SelenonD3Z2R5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SelenonD3Z2R5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SelenonD3Z2R5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SelenonD3Z2R5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SelenonD3Z2R5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SelenonD3Z2R5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SelenonD3Z2R5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SelenonD3Z2R5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SelenonD3Z2R5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SelenonD3Z2R5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SelenonD3Z2R5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SelenonD3Z2R5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SelenonD3Z2R5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SelenonD3Z2R5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SelenonD3Z2R5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SelenonD3Z2R5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SelenonD3Z2R5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SelenonD3Z2R5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SelenonD3Z2R5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SelenonD3Z2R5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SelenonD3Z2R5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SelenonD3Z2R5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SelenonD3Z2R5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SelenonD3Z2R5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SelenonD3Z2R5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SelenonD3Z2R5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SelenonD3Z2R5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SelenonD3Z2R5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SelenonD3Z2R5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SelenonD3Z2R5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SelenonD3Z2R5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SelenonD3Z2R5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SelenonD3Z2R5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SelenonD3Z2R5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SelenonD3Z2R5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SelenonD3Z2R5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SelenonD3Z2R5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SelenonD3Z2R5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SelenonD3Z2R5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SelenonD3Z2R5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SelenonD3Z2R5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SelenonD3Z2R5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SelenonD3Z2R5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SelenonD3Z2R5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SelenonD3Z2R5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SelenonD3Z2R5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SelenonD3Z2R5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SelenonD3Z2R5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SelenonD3Z2R5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SelenonD3Z2R5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SelenonD3Z2R5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SelenonD3Z2R5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SelenonD3Z2R5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SelenonD3Z2R5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SelenonD3Z2R5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SelenonD3Z2R5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SelenonD3Z2R5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SelenonD3Z2R5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SelenonD3Z2R5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SelenonD3Z2R5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SelenonD3Z2R5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SelenonD3Z2R5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SelenonD3Z2R5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SelenonD3Z2R5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SelenonD3Z2R5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SelenonD3Z2R5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SelenonD3Z2R5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SelenonD3Z2R5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SelenonD3Z2R5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SelenonD3Z2R5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SelenonD3Z2R5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77 ms