Protein–RNA interactions for Protein: C3VPR6

Nlrc5, Protein NLRC5, mousemouse

Predictions only

Length 1,915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc5C3VPR6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nlrc5C3VPR6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nlrc5C3VPR6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nlrc5C3VPR6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nlrc5C3VPR6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nlrc5C3VPR6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nlrc5C3VPR6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nlrc5C3VPR6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nlrc5C3VPR6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Nlrc5C3VPR6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nlrc5C3VPR6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Nlrc5C3VPR6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Nlrc5C3VPR6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nlrc5C3VPR6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nlrc5C3VPR6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nlrc5C3VPR6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nlrc5C3VPR6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nlrc5C3VPR6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nlrc5C3VPR6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nlrc5C3VPR6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nlrc5C3VPR6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nlrc5C3VPR6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nlrc5C3VPR6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nlrc5C3VPR6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nlrc5C3VPR6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nlrc5C3VPR6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nlrc5C3VPR6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nlrc5C3VPR6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nlrc5C3VPR6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nlrc5C3VPR6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nlrc5C3VPR6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nlrc5C3VPR6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nlrc5C3VPR6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nlrc5C3VPR6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Nlrc5C3VPR6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nlrc5C3VPR6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Nlrc5C3VPR6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nlrc5C3VPR6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nlrc5C3VPR6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nlrc5C3VPR6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nlrc5C3VPR6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nlrc5C3VPR6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nlrc5C3VPR6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nlrc5C3VPR6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nlrc5C3VPR6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nlrc5C3VPR6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nlrc5C3VPR6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Nlrc5C3VPR6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Nlrc5C3VPR6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nlrc5C3VPR6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Nlrc5C3VPR6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nlrc5C3VPR6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nlrc5C3VPR6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nlrc5C3VPR6 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nlrc5C3VPR6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nlrc5C3VPR6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nlrc5C3VPR6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nlrc5C3VPR6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nlrc5C3VPR6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nlrc5C3VPR6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nlrc5C3VPR6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nlrc5C3VPR6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nlrc5C3VPR6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nlrc5C3VPR6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nlrc5C3VPR6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nlrc5C3VPR6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Nlrc5C3VPR6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nlrc5C3VPR6 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nlrc5C3VPR6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nlrc5C3VPR6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nlrc5C3VPR6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nlrc5C3VPR6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nlrc5C3VPR6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nlrc5C3VPR6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nlrc5C3VPR6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nlrc5C3VPR6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nlrc5C3VPR6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nlrc5C3VPR6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nlrc5C3VPR6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nlrc5C3VPR6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nlrc5C3VPR6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nlrc5C3VPR6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nlrc5C3VPR6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Nlrc5C3VPR6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nlrc5C3VPR6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nlrc5C3VPR6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Nlrc5C3VPR6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nlrc5C3VPR6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nlrc5C3VPR6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nlrc5C3VPR6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nlrc5C3VPR6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nlrc5C3VPR6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Nlrc5C3VPR6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nlrc5C3VPR6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nlrc5C3VPR6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nlrc5C3VPR6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Nlrc5C3VPR6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nlrc5C3VPR6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nlrc5C3VPR6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nlrc5C3VPR6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms