Protein–RNA interactions for Protein: B2RV77

Gm5483, MCG130182, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5483B2RV77 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm5483B2RV77 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm5483B2RV77 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm5483B2RV77 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm5483B2RV77 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm5483B2RV77 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm5483B2RV77 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm5483B2RV77 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm5483B2RV77 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm5483B2RV77 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm5483B2RV77 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm5483B2RV77 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm5483B2RV77 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm5483B2RV77 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm5483B2RV77 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm5483B2RV77 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm5483B2RV77 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm5483B2RV77 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm5483B2RV77 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm5483B2RV77 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm5483B2RV77 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm5483B2RV77 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm5483B2RV77 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm5483B2RV77 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm5483B2RV77 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm5483B2RV77 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm5483B2RV77 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm5483B2RV77 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm5483B2RV77 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm5483B2RV77 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm5483B2RV77 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm5483B2RV77 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm5483B2RV77 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm5483B2RV77 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm5483B2RV77 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm5483B2RV77 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm5483B2RV77 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm5483B2RV77 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm5483B2RV77 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm5483B2RV77 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm5483B2RV77 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm5483B2RV77 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm5483B2RV77 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm5483B2RV77 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm5483B2RV77 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm5483B2RV77 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm5483B2RV77 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm5483B2RV77 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm5483B2RV77 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm5483B2RV77 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm5483B2RV77 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm5483B2RV77 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm5483B2RV77 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm5483B2RV77 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm5483B2RV77 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm5483B2RV77 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm5483B2RV77 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm5483B2RV77 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm5483B2RV77 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm5483B2RV77 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm5483B2RV77 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm5483B2RV77 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm5483B2RV77 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm5483B2RV77 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm5483B2RV77 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm5483B2RV77 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm5483B2RV77 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm5483B2RV77 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Gm5483B2RV77 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm5483B2RV77 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm5483B2RV77 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm5483B2RV77 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm5483B2RV77 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm5483B2RV77 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm5483B2RV77 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm5483B2RV77 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm5483B2RV77 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm5483B2RV77 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm5483B2RV77 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm5483B2RV77 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm5483B2RV77 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm5483B2RV77 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm5483B2RV77 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm5483B2RV77 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm5483B2RV77 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm5483B2RV77 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm5483B2RV77 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm5483B2RV77 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm5483B2RV77 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm5483B2RV77 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm5483B2RV77 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm5483B2RV77 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gm5483B2RV77 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm5483B2RV77 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm5483B2RV77 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm5483B2RV77 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm5483B2RV77 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm5483B2RV77 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm5483B2RV77 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm5483B2RV77 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms