Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Rd3lB2RV38 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rd3lB2RV38 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rd3lB2RV38 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rd3lB2RV38 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rd3lB2RV38 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rd3lB2RV38 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rd3lB2RV38 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rd3lB2RV38 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Rd3lB2RV38 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rd3lB2RV38 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rd3lB2RV38 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rd3lB2RV38 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rd3lB2RV38 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rd3lB2RV38 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rd3lB2RV38 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rd3lB2RV38 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rd3lB2RV38 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rd3lB2RV38 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rd3lB2RV38 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rd3lB2RV38 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rd3lB2RV38 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rd3lB2RV38 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rd3lB2RV38 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Rd3lB2RV38 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rd3lB2RV38 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rd3lB2RV38 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rd3lB2RV38 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rd3lB2RV38 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rd3lB2RV38 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rd3lB2RV38 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rd3lB2RV38 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rd3lB2RV38 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rd3lB2RV38 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rd3lB2RV38 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rd3lB2RV38 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rd3lB2RV38 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rd3lB2RV38 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rd3lB2RV38 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rd3lB2RV38 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rd3lB2RV38 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rd3lB2RV38 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rd3lB2RV38 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rd3lB2RV38 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rd3lB2RV38 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rd3lB2RV38 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rd3lB2RV38 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rd3lB2RV38 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rd3lB2RV38 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rd3lB2RV38 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rd3lB2RV38 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rd3lB2RV38 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rd3lB2RV38 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rd3lB2RV38 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rd3lB2RV38 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rd3lB2RV38 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rd3lB2RV38 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rd3lB2RV38 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rd3lB2RV38 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rd3lB2RV38 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rd3lB2RV38 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rd3lB2RV38 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rd3lB2RV38 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rd3lB2RV38 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rd3lB2RV38 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rd3lB2RV38 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rd3lB2RV38 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rd3lB2RV38 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rd3lB2RV38 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rd3lB2RV38 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rd3lB2RV38 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rd3lB2RV38 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rd3lB2RV38 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rd3lB2RV38 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rd3lB2RV38 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rd3lB2RV38 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rd3lB2RV38 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rd3lB2RV38 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rd3lB2RV38 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rd3lB2RV38 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rd3lB2RV38 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rd3lB2RV38 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rd3lB2RV38 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rd3lB2RV38 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rd3lB2RV38 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rd3lB2RV38 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rd3lB2RV38 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rd3lB2RV38 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rd3lB2RV38 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rd3lB2RV38 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rd3lB2RV38 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rd3lB2RV38 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rd3lB2RV38 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rd3lB2RV38 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rd3lB2RV38 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rd3lB2RV38 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rd3lB2RV38 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rd3lB2RV38 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rd3lB2RV38 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rd3lB2RV38 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.6 ms