Protein–RNA interactions for Protein: A2RT81

Rnf39, MCG22610, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf39A2RT81 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnf39A2RT81 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Rnf39A2RT81 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rnf39A2RT81 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf39A2RT81 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf39A2RT81 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf39A2RT81 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf39A2RT81 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf39A2RT81 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf39A2RT81 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf39A2RT81 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rnf39A2RT81 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rnf39A2RT81 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rnf39A2RT81 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rnf39A2RT81 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf39A2RT81 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf39A2RT81 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf39A2RT81 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf39A2RT81 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf39A2RT81 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf39A2RT81 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf39A2RT81 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Rnf39A2RT81 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Rnf39A2RT81 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rnf39A2RT81 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rnf39A2RT81 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rnf39A2RT81 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnf39A2RT81 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnf39A2RT81 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnf39A2RT81 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnf39A2RT81 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnf39A2RT81 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rnf39A2RT81 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rnf39A2RT81 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rnf39A2RT81 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rnf39A2RT81 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rnf39A2RT81 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rnf39A2RT81 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rnf39A2RT81 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rnf39A2RT81 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rnf39A2RT81 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rnf39A2RT81 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rnf39A2RT81 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rnf39A2RT81 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rnf39A2RT81 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rnf39A2RT81 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rnf39A2RT81 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rnf39A2RT81 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rnf39A2RT81 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rnf39A2RT81 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rnf39A2RT81 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rnf39A2RT81 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rnf39A2RT81 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rnf39A2RT81 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rnf39A2RT81 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rnf39A2RT81 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rnf39A2RT81 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Rnf39A2RT81 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rnf39A2RT81 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rnf39A2RT81 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rnf39A2RT81 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnf39A2RT81 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnf39A2RT81 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnf39A2RT81 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnf39A2RT81 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnf39A2RT81 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnf39A2RT81 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnf39A2RT81 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnf39A2RT81 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rnf39A2RT81 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Rnf39A2RT81 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rnf39A2RT81 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rnf39A2RT81 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rnf39A2RT81 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rnf39A2RT81 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rnf39A2RT81 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rnf39A2RT81 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rnf39A2RT81 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnf39A2RT81 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnf39A2RT81 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnf39A2RT81 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnf39A2RT81 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnf39A2RT81 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnf39A2RT81 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnf39A2RT81 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnf39A2RT81 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnf39A2RT81 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnf39A2RT81 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnf39A2RT81 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnf39A2RT81 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnf39A2RT81 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnf39A2RT81 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnf39A2RT81 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rnf39A2RT81 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Rnf39A2RT81 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rnf39A2RT81 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Rnf39A2RT81 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rnf39A2RT81 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rnf39A2RT81 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rnf39A2RT81 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms