Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rtf1A2AQ19 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rtf1A2AQ19 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Rtf1A2AQ19 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Rtf1A2AQ19 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Rtf1A2AQ19 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Rtf1A2AQ19 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Rtf1A2AQ19 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Rtf1A2AQ19 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Rtf1A2AQ19 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC29.26■■■□□ 2.28
Rtf1A2AQ19 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
Rtf1A2AQ19 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Rtf1A2AQ19 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Rtf1A2AQ19 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Rtf1A2AQ19 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Rtf1A2AQ19 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Rtf1A2AQ19 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Rtf1A2AQ19 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Rtf1A2AQ19 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Rtf1A2AQ19 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Rtf1A2AQ19 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Rtf1A2AQ19 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Rtf1A2AQ19 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Rtf1A2AQ19 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Rtf1A2AQ19 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Rtf1A2AQ19 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Rtf1A2AQ19 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Rtf1A2AQ19 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Rtf1A2AQ19 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Rtf1A2AQ19 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Rtf1A2AQ19 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Rtf1A2AQ19 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Rtf1A2AQ19 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Rtf1A2AQ19 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Rtf1A2AQ19 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Rtf1A2AQ19 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Rtf1A2AQ19 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Rtf1A2AQ19 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Rtf1A2AQ19 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Rtf1A2AQ19 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Rtf1A2AQ19 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Rtf1A2AQ19 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Rtf1A2AQ19 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Rtf1A2AQ19 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Rtf1A2AQ19 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Rtf1A2AQ19 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Rtf1A2AQ19 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Rtf1A2AQ19 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Rtf1A2AQ19 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Rtf1A2AQ19 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Rtf1A2AQ19 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Rtf1A2AQ19 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Rtf1A2AQ19 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Rtf1A2AQ19 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Rtf1A2AQ19 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Rtf1A2AQ19 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Rtf1A2AQ19 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Rtf1A2AQ19 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Rtf1A2AQ19 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Rtf1A2AQ19 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Rtf1A2AQ19 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Rtf1A2AQ19 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Rtf1A2AQ19 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Rtf1A2AQ19 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Rtf1A2AQ19 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Rtf1A2AQ19 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Rtf1A2AQ19 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Rtf1A2AQ19 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Rtf1A2AQ19 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Rtf1A2AQ19 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rtf1A2AQ19 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rtf1A2AQ19 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rtf1A2AQ19 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rtf1A2AQ19 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Rtf1A2AQ19 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rtf1A2AQ19 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Rtf1A2AQ19 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rtf1A2AQ19 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rtf1A2AQ19 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rtf1A2AQ19 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rtf1A2AQ19 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rtf1A2AQ19 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rtf1A2AQ19 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rtf1A2AQ19 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rtf1A2AQ19 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rtf1A2AQ19 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rtf1A2AQ19 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rtf1A2AQ19 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rtf1A2AQ19 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rtf1A2AQ19 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rtf1A2AQ19 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rtf1A2AQ19 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rtf1A2AQ19 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rtf1A2AQ19 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rtf1A2AQ19 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rtf1A2AQ19 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Rtf1A2AQ19 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Rtf1A2AQ19 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Rtf1A2AQ19 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Rtf1A2AQ19 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms