Protein–RNA interactions for Protein: A2AMW3

Gabre, Gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabreA2AMW3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GabreA2AMW3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GabreA2AMW3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GabreA2AMW3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
GabreA2AMW3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GabreA2AMW3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GabreA2AMW3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
GabreA2AMW3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
GabreA2AMW3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GabreA2AMW3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GabreA2AMW3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GabreA2AMW3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
GabreA2AMW3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
GabreA2AMW3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GabreA2AMW3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GabreA2AMW3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GabreA2AMW3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GabreA2AMW3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GabreA2AMW3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GabreA2AMW3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GabreA2AMW3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GabreA2AMW3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GabreA2AMW3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GabreA2AMW3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
GabreA2AMW3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
GabreA2AMW3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GabreA2AMW3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GabreA2AMW3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GabreA2AMW3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
GabreA2AMW3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GabreA2AMW3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GabreA2AMW3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GabreA2AMW3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GabreA2AMW3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GabreA2AMW3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GabreA2AMW3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GabreA2AMW3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GabreA2AMW3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GabreA2AMW3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GabreA2AMW3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GabreA2AMW3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GabreA2AMW3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GabreA2AMW3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GabreA2AMW3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
GabreA2AMW3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GabreA2AMW3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GabreA2AMW3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GabreA2AMW3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GabreA2AMW3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GabreA2AMW3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GabreA2AMW3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GabreA2AMW3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GabreA2AMW3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GabreA2AMW3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GabreA2AMW3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GabreA2AMW3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GabreA2AMW3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GabreA2AMW3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GabreA2AMW3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GabreA2AMW3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
GabreA2AMW3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GabreA2AMW3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GabreA2AMW3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GabreA2AMW3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
GabreA2AMW3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GabreA2AMW3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GabreA2AMW3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GabreA2AMW3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GabreA2AMW3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GabreA2AMW3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GabreA2AMW3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GabreA2AMW3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GabreA2AMW3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GabreA2AMW3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GabreA2AMW3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GabreA2AMW3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GabreA2AMW3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GabreA2AMW3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GabreA2AMW3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GabreA2AMW3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GabreA2AMW3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GabreA2AMW3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GabreA2AMW3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GabreA2AMW3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GabreA2AMW3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GabreA2AMW3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GabreA2AMW3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GabreA2AMW3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GabreA2AMW3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GabreA2AMW3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GabreA2AMW3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GabreA2AMW3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GabreA2AMW3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GabreA2AMW3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GabreA2AMW3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GabreA2AMW3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GabreA2AMW3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GabreA2AMW3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GabreA2AMW3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GabreA2AMW3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms