Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
Frmpd1A2AKB4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC40.01■■■■□ 3.99
Frmpd1A2AKB4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC40■■■■□ 3.99
Frmpd1A2AKB4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
Frmpd1A2AKB4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC40■■■■□ 3.99
Frmpd1A2AKB4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
Frmpd1A2AKB4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC39.99■■■■□ 3.99
Frmpd1A2AKB4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC39.99■■■■□ 3.99
Frmpd1A2AKB4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
Frmpd1A2AKB4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
Frmpd1A2AKB4 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
Frmpd1A2AKB4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
Frmpd1A2AKB4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
Frmpd1A2AKB4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
Frmpd1A2AKB4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
Frmpd1A2AKB4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
Frmpd1A2AKB4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC39.96■■■■□ 3.99
Frmpd1A2AKB4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
Frmpd1A2AKB4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
Frmpd1A2AKB4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
Frmpd1A2AKB4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.94■■■■□ 3.98
Frmpd1A2AKB4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
Frmpd1A2AKB4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.94■■■■□ 3.98
Frmpd1A2AKB4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
Frmpd1A2AKB4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
Frmpd1A2AKB4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
Frmpd1A2AKB4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
Frmpd1A2AKB4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.91■■■■□ 3.98
Frmpd1A2AKB4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC39.91■■■■□ 3.98
Frmpd1A2AKB4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
Frmpd1A2AKB4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
Frmpd1A2AKB4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
Frmpd1A2AKB4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
Frmpd1A2AKB4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
Frmpd1A2AKB4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
Frmpd1A2AKB4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC39.87■■■■□ 3.97
Frmpd1A2AKB4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC39.86■■■■□ 3.97
Frmpd1A2AKB4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC39.86■■■■□ 3.97
Frmpd1A2AKB4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
Frmpd1A2AKB4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
Frmpd1A2AKB4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC39.85■■■■□ 3.97
Frmpd1A2AKB4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
Frmpd1A2AKB4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
Frmpd1A2AKB4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
Frmpd1A2AKB4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
Frmpd1A2AKB4 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
Frmpd1A2AKB4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC39.82■■■■□ 3.97
Frmpd1A2AKB4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.82■■■■□ 3.96
Frmpd1A2AKB4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.96
Frmpd1A2AKB4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
Frmpd1A2AKB4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
Frmpd1A2AKB4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC39.81■■■■□ 3.96
Frmpd1A2AKB4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
Frmpd1A2AKB4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
Frmpd1A2AKB4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
Frmpd1A2AKB4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC39.78■■■■□ 3.96
Frmpd1A2AKB4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC39.77■■■■□ 3.96
Frmpd1A2AKB4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
Frmpd1A2AKB4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC39.76■■■■□ 3.95
Frmpd1A2AKB4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC39.76■■■■□ 3.95
Frmpd1A2AKB4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
Frmpd1A2AKB4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC39.75■■■■□ 3.95
Frmpd1A2AKB4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
Frmpd1A2AKB4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
Frmpd1A2AKB4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
Frmpd1A2AKB4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC39.73■■■■□ 3.95
Frmpd1A2AKB4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC39.73■■■■□ 3.95
Frmpd1A2AKB4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
Frmpd1A2AKB4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
Frmpd1A2AKB4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC39.71■■■■□ 3.95
Frmpd1A2AKB4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC39.7■■■■□ 3.95
Frmpd1A2AKB4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC39.7■■■■□ 3.95
Frmpd1A2AKB4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC39.7■■■■□ 3.95
Frmpd1A2AKB4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
Frmpd1A2AKB4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC39.7■■■■□ 3.95
Frmpd1A2AKB4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC39.7■■■■□ 3.95
Frmpd1A2AKB4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
Frmpd1A2AKB4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC39.69■■■■□ 3.94
Frmpd1A2AKB4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.69■■■■□ 3.94
Frmpd1A2AKB4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
Frmpd1A2AKB4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
Frmpd1A2AKB4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
Frmpd1A2AKB4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
Frmpd1A2AKB4 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC39.67■■■■□ 3.94
Frmpd1A2AKB4 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC39.67■■■■□ 3.94
Frmpd1A2AKB4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
Frmpd1A2AKB4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
Frmpd1A2AKB4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
Frmpd1A2AKB4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
Frmpd1A2AKB4 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
Frmpd1A2AKB4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC39.65■■■■□ 3.94
Frmpd1A2AKB4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC39.65■■■■□ 3.94
Frmpd1A2AKB4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
Frmpd1A2AKB4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
Frmpd1A2AKB4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.64■■■■□ 3.94
Frmpd1A2AKB4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.94
Frmpd1A2AKB4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC39.63■■■■□ 3.93
Frmpd1A2AKB4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.93
Frmpd1A2AKB4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC39.62■■■■□ 3.93
Frmpd1A2AKB4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.5 ms