Protein–RNA interactions for Protein: A2A9F4

Kdf1, Keratinocyte differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdf1A2A9F4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kdf1A2A9F4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kdf1A2A9F4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kdf1A2A9F4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kdf1A2A9F4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kdf1A2A9F4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kdf1A2A9F4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kdf1A2A9F4 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kdf1A2A9F4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kdf1A2A9F4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kdf1A2A9F4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kdf1A2A9F4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kdf1A2A9F4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kdf1A2A9F4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kdf1A2A9F4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kdf1A2A9F4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kdf1A2A9F4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kdf1A2A9F4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kdf1A2A9F4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kdf1A2A9F4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kdf1A2A9F4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Kdf1A2A9F4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kdf1A2A9F4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kdf1A2A9F4 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kdf1A2A9F4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Kdf1A2A9F4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kdf1A2A9F4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kdf1A2A9F4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kdf1A2A9F4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kdf1A2A9F4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kdf1A2A9F4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kdf1A2A9F4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kdf1A2A9F4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kdf1A2A9F4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Kdf1A2A9F4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Kdf1A2A9F4 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kdf1A2A9F4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kdf1A2A9F4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kdf1A2A9F4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kdf1A2A9F4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kdf1A2A9F4 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kdf1A2A9F4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kdf1A2A9F4 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kdf1A2A9F4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kdf1A2A9F4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kdf1A2A9F4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kdf1A2A9F4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kdf1A2A9F4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kdf1A2A9F4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kdf1A2A9F4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kdf1A2A9F4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kdf1A2A9F4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kdf1A2A9F4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kdf1A2A9F4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kdf1A2A9F4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kdf1A2A9F4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kdf1A2A9F4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kdf1A2A9F4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kdf1A2A9F4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kdf1A2A9F4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kdf1A2A9F4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Kdf1A2A9F4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Kdf1A2A9F4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Kdf1A2A9F4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Kdf1A2A9F4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Kdf1A2A9F4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Kdf1A2A9F4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Kdf1A2A9F4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Kdf1A2A9F4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kdf1A2A9F4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Kdf1A2A9F4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Kdf1A2A9F4 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kdf1A2A9F4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Kdf1A2A9F4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kdf1A2A9F4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kdf1A2A9F4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kdf1A2A9F4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kdf1A2A9F4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Kdf1A2A9F4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Kdf1A2A9F4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kdf1A2A9F4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Kdf1A2A9F4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Kdf1A2A9F4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kdf1A2A9F4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kdf1A2A9F4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kdf1A2A9F4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Kdf1A2A9F4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Kdf1A2A9F4 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Kdf1A2A9F4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Kdf1A2A9F4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kdf1A2A9F4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kdf1A2A9F4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kdf1A2A9F4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kdf1A2A9F4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kdf1A2A9F4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kdf1A2A9F4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kdf1A2A9F4 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kdf1A2A9F4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kdf1A2A9F4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kdf1A2A9F4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms