Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H9

Igkv1-132, Immunoglobulin kappa variable 1-132 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Igkv1-132A0A0B4J1H9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Igkv1-132A0A0B4J1H9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Igkv1-132A0A0B4J1H9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Igkv1-132A0A0B4J1H9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Igkv1-132A0A0B4J1H9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Igkv1-132A0A0B4J1H9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Igkv1-132A0A0B4J1H9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Igkv1-132A0A0B4J1H9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Igkv1-132A0A0B4J1H9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms