Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms