Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W1

THRAP3, Thyroid hormone receptor-associated protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 955 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP3Q9Y2W1 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
THRAP3Q9Y2W1 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
THRAP3Q9Y2W1 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
THRAP3Q9Y2W1 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
THRAP3Q9Y2W1 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
THRAP3Q9Y2W1 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
THRAP3Q9Y2W1 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
THRAP3Q9Y2W1 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
THRAP3Q9Y2W1 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
THRAP3Q9Y2W1 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
THRAP3Q9Y2W1 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
THRAP3Q9Y2W1 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
THRAP3Q9Y2W1 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
THRAP3Q9Y2W1 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
THRAP3Q9Y2W1 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
THRAP3Q9Y2W1 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
THRAP3Q9Y2W1 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
THRAP3Q9Y2W1 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
THRAP3Q9Y2W1 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
THRAP3Q9Y2W1 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
THRAP3Q9Y2W1 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
THRAP3Q9Y2W1 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
THRAP3Q9Y2W1 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
THRAP3Q9Y2W1 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
THRAP3Q9Y2W1 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
THRAP3Q9Y2W1 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
THRAP3Q9Y2W1 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
THRAP3Q9Y2W1 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
THRAP3Q9Y2W1 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
THRAP3Q9Y2W1 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
THRAP3Q9Y2W1 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
THRAP3Q9Y2W1 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
THRAP3Q9Y2W1 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
THRAP3Q9Y2W1 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
THRAP3Q9Y2W1 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
THRAP3Q9Y2W1 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
THRAP3Q9Y2W1 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
THRAP3Q9Y2W1 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
THRAP3Q9Y2W1 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
THRAP3Q9Y2W1 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
THRAP3Q9Y2W1 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
THRAP3Q9Y2W1 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
THRAP3Q9Y2W1 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
THRAP3Q9Y2W1 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
THRAP3Q9Y2W1 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
THRAP3Q9Y2W1 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
THRAP3Q9Y2W1 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
THRAP3Q9Y2W1 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
THRAP3Q9Y2W1 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
THRAP3Q9Y2W1 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
THRAP3Q9Y2W1 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
THRAP3Q9Y2W1 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
THRAP3Q9Y2W1 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
THRAP3Q9Y2W1 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
THRAP3Q9Y2W1 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
THRAP3Q9Y2W1 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
THRAP3Q9Y2W1 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
THRAP3Q9Y2W1 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
THRAP3Q9Y2W1 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
THRAP3Q9Y2W1 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
THRAP3Q9Y2W1 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
THRAP3Q9Y2W1 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
THRAP3Q9Y2W1 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
THRAP3Q9Y2W1 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
THRAP3Q9Y2W1 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
THRAP3Q9Y2W1 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
THRAP3Q9Y2W1 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
THRAP3Q9Y2W1 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
THRAP3Q9Y2W1 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
THRAP3Q9Y2W1 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
THRAP3Q9Y2W1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
THRAP3Q9Y2W1 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
THRAP3Q9Y2W1 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
THRAP3Q9Y2W1 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
THRAP3Q9Y2W1 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
THRAP3Q9Y2W1 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
THRAP3Q9Y2W1 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
THRAP3Q9Y2W1 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
THRAP3Q9Y2W1 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
THRAP3Q9Y2W1 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
THRAP3Q9Y2W1 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
THRAP3Q9Y2W1 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
THRAP3Q9Y2W1 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
THRAP3Q9Y2W1 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
THRAP3Q9Y2W1 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
THRAP3Q9Y2W1 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
THRAP3Q9Y2W1 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
THRAP3Q9Y2W1 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
THRAP3Q9Y2W1 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
THRAP3Q9Y2W1 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
THRAP3Q9Y2W1 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
THRAP3Q9Y2W1 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
THRAP3Q9Y2W1 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
THRAP3Q9Y2W1 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
THRAP3Q9Y2W1 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
THRAP3Q9Y2W1 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
THRAP3Q9Y2W1 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
THRAP3Q9Y2W1 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
THRAP3Q9Y2W1 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
THRAP3Q9Y2W1 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms