Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms