Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLSPNQ9HAW4 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CLSPNQ9HAW4 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CLSPNQ9HAW4 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLSPNQ9HAW4 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLSPNQ9HAW4 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLSPNQ9HAW4 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLSPNQ9HAW4 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLSPNQ9HAW4 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLSPNQ9HAW4 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLSPNQ9HAW4 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CLSPNQ9HAW4 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLSPNQ9HAW4 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CLSPNQ9HAW4 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLSPNQ9HAW4 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CLSPNQ9HAW4 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLSPNQ9HAW4 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLSPNQ9HAW4 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLSPNQ9HAW4 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLSPNQ9HAW4 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLSPNQ9HAW4 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLSPNQ9HAW4 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLSPNQ9HAW4 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLSPNQ9HAW4 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CLSPNQ9HAW4 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLSPNQ9HAW4 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLSPNQ9HAW4 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CLSPNQ9HAW4 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLSPNQ9HAW4 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLSPNQ9HAW4 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CLSPNQ9HAW4 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLSPNQ9HAW4 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLSPNQ9HAW4 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLSPNQ9HAW4 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLSPNQ9HAW4 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLSPNQ9HAW4 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CLSPNQ9HAW4 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLSPNQ9HAW4 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLSPNQ9HAW4 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CLSPNQ9HAW4 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLSPNQ9HAW4 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLSPNQ9HAW4 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLSPNQ9HAW4 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLSPNQ9HAW4 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLSPNQ9HAW4 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLSPNQ9HAW4 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLSPNQ9HAW4 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLSPNQ9HAW4 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLSPNQ9HAW4 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLSPNQ9HAW4 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLSPNQ9HAW4 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLSPNQ9HAW4 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLSPNQ9HAW4 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLSPNQ9HAW4 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLSPNQ9HAW4 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLSPNQ9HAW4 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLSPNQ9HAW4 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLSPNQ9HAW4 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLSPNQ9HAW4 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLSPNQ9HAW4 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLSPNQ9HAW4 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLSPNQ9HAW4 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLSPNQ9HAW4 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLSPNQ9HAW4 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLSPNQ9HAW4 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLSPNQ9HAW4 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLSPNQ9HAW4 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLSPNQ9HAW4 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLSPNQ9HAW4 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLSPNQ9HAW4 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CLSPNQ9HAW4 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CLSPNQ9HAW4 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CLSPNQ9HAW4 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CLSPNQ9HAW4 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CLSPNQ9HAW4 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CLSPNQ9HAW4 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CLSPNQ9HAW4 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CLSPNQ9HAW4 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CLSPNQ9HAW4 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CLSPNQ9HAW4 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CLSPNQ9HAW4 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLSPNQ9HAW4 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLSPNQ9HAW4 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLSPNQ9HAW4 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLSPNQ9HAW4 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLSPNQ9HAW4 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLSPNQ9HAW4 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLSPNQ9HAW4 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLSPNQ9HAW4 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLSPNQ9HAW4 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLSPNQ9HAW4 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLSPNQ9HAW4 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLSPNQ9HAW4 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLSPNQ9HAW4 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.9 ms