Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RNF17Q9BXT8 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RNF17Q9BXT8 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RNF17Q9BXT8 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RNF17Q9BXT8 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RNF17Q9BXT8 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RNF17Q9BXT8 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RNF17Q9BXT8 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RNF17Q9BXT8 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RNF17Q9BXT8 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RNF17Q9BXT8 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
RNF17Q9BXT8 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RNF17Q9BXT8 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RNF17Q9BXT8 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RNF17Q9BXT8 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RNF17Q9BXT8 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RNF17Q9BXT8 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RNF17Q9BXT8 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RNF17Q9BXT8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RNF17Q9BXT8 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RNF17Q9BXT8 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RNF17Q9BXT8 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RNF17Q9BXT8 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RNF17Q9BXT8 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RNF17Q9BXT8 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RNF17Q9BXT8 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RNF17Q9BXT8 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RNF17Q9BXT8 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
RNF17Q9BXT8 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RNF17Q9BXT8 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RNF17Q9BXT8 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RNF17Q9BXT8 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RNF17Q9BXT8 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RNF17Q9BXT8 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RNF17Q9BXT8 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RNF17Q9BXT8 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
RNF17Q9BXT8 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RNF17Q9BXT8 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RNF17Q9BXT8 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RNF17Q9BXT8 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
RNF17Q9BXT8 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RNF17Q9BXT8 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RNF17Q9BXT8 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RNF17Q9BXT8 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
RNF17Q9BXT8 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RNF17Q9BXT8 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RNF17Q9BXT8 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RNF17Q9BXT8 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RNF17Q9BXT8 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RNF17Q9BXT8 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RNF17Q9BXT8 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
RNF17Q9BXT8 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RNF17Q9BXT8 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RNF17Q9BXT8 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RNF17Q9BXT8 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RNF17Q9BXT8 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RNF17Q9BXT8 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RNF17Q9BXT8 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
RNF17Q9BXT8 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
RNF17Q9BXT8 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
RNF17Q9BXT8 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
RNF17Q9BXT8 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RNF17Q9BXT8 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RNF17Q9BXT8 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RNF17Q9BXT8 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RNF17Q9BXT8 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RNF17Q9BXT8 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RNF17Q9BXT8 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RNF17Q9BXT8 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RNF17Q9BXT8 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RNF17Q9BXT8 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RNF17Q9BXT8 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RNF17Q9BXT8 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RNF17Q9BXT8 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RNF17Q9BXT8 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RNF17Q9BXT8 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RNF17Q9BXT8 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
RNF17Q9BXT8 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RNF17Q9BXT8 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RNF17Q9BXT8 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RNF17Q9BXT8 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RNF17Q9BXT8 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RNF17Q9BXT8 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RNF17Q9BXT8 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RNF17Q9BXT8 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RNF17Q9BXT8 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RNF17Q9BXT8 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RNF17Q9BXT8 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RNF17Q9BXT8 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RNF17Q9BXT8 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RNF17Q9BXT8 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RNF17Q9BXT8 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RNF17Q9BXT8 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RNF17Q9BXT8 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RNF17Q9BXT8 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RNF17Q9BXT8 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RNF17Q9BXT8 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
RNF17Q9BXT8 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RNF17Q9BXT8 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RNF17Q9BXT8 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms