Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC106Q9BWC9 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC106Q9BWC9 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC106Q9BWC9 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC106Q9BWC9 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC106Q9BWC9 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC106Q9BWC9 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC106Q9BWC9 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC106Q9BWC9 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC106Q9BWC9 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC106Q9BWC9 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC106Q9BWC9 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC106Q9BWC9 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC106Q9BWC9 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC106Q9BWC9 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC106Q9BWC9 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC106Q9BWC9 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC106Q9BWC9 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC106Q9BWC9 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC106Q9BWC9 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC106Q9BWC9 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC106Q9BWC9 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC106Q9BWC9 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC106Q9BWC9 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC106Q9BWC9 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC106Q9BWC9 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC106Q9BWC9 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC106Q9BWC9 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC106Q9BWC9 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC106Q9BWC9 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC106Q9BWC9 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC106Q9BWC9 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC106Q9BWC9 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC106Q9BWC9 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC106Q9BWC9 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC106Q9BWC9 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC106Q9BWC9 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC106Q9BWC9 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC106Q9BWC9 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC106Q9BWC9 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC106Q9BWC9 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC106Q9BWC9 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC106Q9BWC9 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC106Q9BWC9 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC106Q9BWC9 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC106Q9BWC9 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC106Q9BWC9 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC106Q9BWC9 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC106Q9BWC9 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC106Q9BWC9 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC106Q9BWC9 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC106Q9BWC9 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC106Q9BWC9 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC106Q9BWC9 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC106Q9BWC9 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC106Q9BWC9 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC106Q9BWC9 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC106Q9BWC9 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC106Q9BWC9 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC106Q9BWC9 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC106Q9BWC9 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC106Q9BWC9 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC106Q9BWC9 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC106Q9BWC9 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC106Q9BWC9 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC106Q9BWC9 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC106Q9BWC9 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC106Q9BWC9 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC106Q9BWC9 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC106Q9BWC9 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC106Q9BWC9 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC106Q9BWC9 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC106Q9BWC9 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC106Q9BWC9 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC106Q9BWC9 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC106Q9BWC9 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC106Q9BWC9 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC106Q9BWC9 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC106Q9BWC9 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC106Q9BWC9 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC106Q9BWC9 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC106Q9BWC9 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC106Q9BWC9 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC106Q9BWC9 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC106Q9BWC9 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC106Q9BWC9 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC106Q9BWC9 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC106Q9BWC9 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC106Q9BWC9 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC106Q9BWC9 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC106Q9BWC9 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC106Q9BWC9 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC106Q9BWC9 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC106Q9BWC9 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC106Q9BWC9 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC106Q9BWC9 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC106Q9BWC9 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC106Q9BWC9 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC106Q9BWC9 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC106Q9BWC9 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms