Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW8

NIPSNAP1, Protein NipSnap homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP1Q9BPW8 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86 ms