Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q04

LMTK3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK3Q96Q04 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMTK3Q96Q04 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMTK3Q96Q04 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMTK3Q96Q04 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMTK3Q96Q04 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMTK3Q96Q04 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMTK3Q96Q04 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMTK3Q96Q04 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMTK3Q96Q04 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMTK3Q96Q04 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMTK3Q96Q04 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMTK3Q96Q04 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMTK3Q96Q04 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMTK3Q96Q04 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMTK3Q96Q04 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
LMTK3Q96Q04 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMTK3Q96Q04 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
LMTK3Q96Q04 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMTK3Q96Q04 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMTK3Q96Q04 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMTK3Q96Q04 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMTK3Q96Q04 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMTK3Q96Q04 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMTK3Q96Q04 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMTK3Q96Q04 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMTK3Q96Q04 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMTK3Q96Q04 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMTK3Q96Q04 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
LMTK3Q96Q04 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMTK3Q96Q04 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMTK3Q96Q04 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMTK3Q96Q04 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMTK3Q96Q04 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
LMTK3Q96Q04 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMTK3Q96Q04 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMTK3Q96Q04 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMTK3Q96Q04 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMTK3Q96Q04 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMTK3Q96Q04 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMTK3Q96Q04 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMTK3Q96Q04 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMTK3Q96Q04 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMTK3Q96Q04 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMTK3Q96Q04 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
LMTK3Q96Q04 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMTK3Q96Q04 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMTK3Q96Q04 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMTK3Q96Q04 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMTK3Q96Q04 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMTK3Q96Q04 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
LMTK3Q96Q04 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMTK3Q96Q04 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
LMTK3Q96Q04 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMTK3Q96Q04 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMTK3Q96Q04 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMTK3Q96Q04 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMTK3Q96Q04 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMTK3Q96Q04 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMTK3Q96Q04 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMTK3Q96Q04 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMTK3Q96Q04 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMTK3Q96Q04 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMTK3Q96Q04 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMTK3Q96Q04 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMTK3Q96Q04 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMTK3Q96Q04 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMTK3Q96Q04 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMTK3Q96Q04 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMTK3Q96Q04 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMTK3Q96Q04 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMTK3Q96Q04 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
LMTK3Q96Q04 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMTK3Q96Q04 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMTK3Q96Q04 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMTK3Q96Q04 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMTK3Q96Q04 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMTK3Q96Q04 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMTK3Q96Q04 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMTK3Q96Q04 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
LMTK3Q96Q04 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMTK3Q96Q04 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMTK3Q96Q04 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMTK3Q96Q04 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMTK3Q96Q04 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMTK3Q96Q04 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMTK3Q96Q04 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
LMTK3Q96Q04 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
LMTK3Q96Q04 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LMTK3Q96Q04 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
LMTK3Q96Q04 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LMTK3Q96Q04 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LMTK3Q96Q04 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LMTK3Q96Q04 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LMTK3Q96Q04 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LMTK3Q96Q04 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LMTK3Q96Q04 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LMTK3Q96Q04 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LMTK3Q96Q04 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LMTK3Q96Q04 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LMTK3Q96Q04 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms