Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ0

DCHS1, Protocadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 3,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCHS1Q96JQ0 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DCHS1Q96JQ0 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DCHS1Q96JQ0 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DCHS1Q96JQ0 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DCHS1Q96JQ0 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DCHS1Q96JQ0 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DCHS1Q96JQ0 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DCHS1Q96JQ0 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DCHS1Q96JQ0 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms