Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms