Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMGN3Q15651 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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