Protein–RNA interactions for Protein: Q15139

PRKD1, Serine/threonine-protein kinase D1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD1Q15139 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms