Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Apoc2Q05020 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Apoc2Q05020 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Apoc2Q05020 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Apoc2Q05020 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Apoc2Q05020 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Apoc2Q05020 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Apoc2Q05020 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Apoc2Q05020 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Apoc2Q05020 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Apoc2Q05020 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Apoc2Q05020 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Apoc2Q05020 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Apoc2Q05020 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Apoc2Q05020 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Apoc2Q05020 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Apoc2Q05020 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Apoc2Q05020 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Apoc2Q05020 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Apoc2Q05020 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Apoc2Q05020 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Apoc2Q05020 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Apoc2Q05020 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Apoc2Q05020 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Apoc2Q05020 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Apoc2Q05020 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Apoc2Q05020 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Apoc2Q05020 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Apoc2Q05020 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Apoc2Q05020 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Apoc2Q05020 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Apoc2Q05020 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Apoc2Q05020 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Apoc2Q05020 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Apoc2Q05020 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Apoc2Q05020 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Apoc2Q05020 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Apoc2Q05020 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Apoc2Q05020 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Apoc2Q05020 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Apoc2Q05020 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Apoc2Q05020 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Apoc2Q05020 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Apoc2Q05020 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Apoc2Q05020 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Apoc2Q05020 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Apoc2Q05020 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Apoc2Q05020 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Apoc2Q05020 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Apoc2Q05020 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Apoc2Q05020 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Apoc2Q05020 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Apoc2Q05020 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Apoc2Q05020 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Apoc2Q05020 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Apoc2Q05020 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Apoc2Q05020 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Apoc2Q05020 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Apoc2Q05020 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Apoc2Q05020 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Apoc2Q05020 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Apoc2Q05020 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Apoc2Q05020 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Apoc2Q05020 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Apoc2Q05020 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Apoc2Q05020 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Apoc2Q05020 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Apoc2Q05020 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Apoc2Q05020 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Apoc2Q05020 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Apoc2Q05020 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Apoc2Q05020 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Apoc2Q05020 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Apoc2Q05020 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Apoc2Q05020 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Apoc2Q05020 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apoc2Q05020 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apoc2Q05020 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apoc2Q05020 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apoc2Q05020 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apoc2Q05020 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apoc2Q05020 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apoc2Q05020 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apoc2Q05020 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apoc2Q05020 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apoc2Q05020 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apoc2Q05020 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apoc2Q05020 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apoc2Q05020 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apoc2Q05020 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apoc2Q05020 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apoc2Q05020 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apoc2Q05020 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apoc2Q05020 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apoc2Q05020 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apoc2Q05020 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apoc2Q05020 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apoc2Q05020 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apoc2Q05020 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apoc2Q05020 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms