Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms