Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms