Protein–RNA interactions for Protein: A2A3V1

Akap17b, A-kinase anchor protein 17B, mousemouse

Predictions only

Length 959 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Akap17bA2A3V1 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Akap17bA2A3V1 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Akap17bA2A3V1 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Akap17bA2A3V1 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Akap17bA2A3V1 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Akap17bA2A3V1 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Akap17bA2A3V1 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Akap17bA2A3V1 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Akap17bA2A3V1 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Akap17bA2A3V1 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Akap17bA2A3V1 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Akap17bA2A3V1 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Akap17bA2A3V1 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Akap17bA2A3V1 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Akap17bA2A3V1 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Akap17bA2A3V1 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Akap17bA2A3V1 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Akap17bA2A3V1 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Akap17bA2A3V1 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Akap17bA2A3V1 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Akap17bA2A3V1 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Akap17bA2A3V1 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Akap17bA2A3V1 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Akap17bA2A3V1 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Akap17bA2A3V1 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Akap17bA2A3V1 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Akap17bA2A3V1 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Akap17bA2A3V1 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Akap17bA2A3V1 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Akap17bA2A3V1 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Akap17bA2A3V1 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Akap17bA2A3V1 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Akap17bA2A3V1 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Akap17bA2A3V1 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Akap17bA2A3V1 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Akap17bA2A3V1 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Akap17bA2A3V1 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Akap17bA2A3V1 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Akap17bA2A3V1 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Akap17bA2A3V1 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Akap17bA2A3V1 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Akap17bA2A3V1 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Akap17bA2A3V1 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Akap17bA2A3V1 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Akap17bA2A3V1 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Akap17bA2A3V1 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Akap17bA2A3V1 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Akap17bA2A3V1 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Akap17bA2A3V1 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Akap17bA2A3V1 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Akap17bA2A3V1 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Akap17bA2A3V1 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Akap17bA2A3V1 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Akap17bA2A3V1 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Akap17bA2A3V1 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Akap17bA2A3V1 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Akap17bA2A3V1 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Akap17bA2A3V1 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Akap17bA2A3V1 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Akap17bA2A3V1 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Akap17bA2A3V1 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Akap17bA2A3V1 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Akap17bA2A3V1 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Akap17bA2A3V1 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Akap17bA2A3V1 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Akap17bA2A3V1 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Akap17bA2A3V1 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Akap17bA2A3V1 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Akap17bA2A3V1 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Akap17bA2A3V1 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Akap17bA2A3V1 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Akap17bA2A3V1 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Akap17bA2A3V1 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Akap17bA2A3V1 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Akap17bA2A3V1 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Akap17bA2A3V1 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Akap17bA2A3V1 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Akap17bA2A3V1 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Akap17bA2A3V1 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Akap17bA2A3V1 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Akap17bA2A3V1 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Akap17bA2A3V1 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Akap17bA2A3V1 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Akap17bA2A3V1 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Akap17bA2A3V1 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Akap17bA2A3V1 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Akap17bA2A3V1 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Akap17bA2A3V1 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Akap17bA2A3V1 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Akap17bA2A3V1 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Akap17bA2A3V1 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Akap17bA2A3V1 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Akap17bA2A3V1 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Akap17bA2A3V1 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Akap17bA2A3V1 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Akap17bA2A3V1 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Akap17bA2A3V1 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Akap17bA2A3V1 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Akap17bA2A3V1 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Akap17bA2A3V1 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms