Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms