Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM5Q9C035 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TRIM5Q9C035 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TRIM5Q9C035 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM5Q9C035 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM5Q9C035 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM5Q9C035 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM5Q9C035 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM5Q9C035 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM5Q9C035 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM5Q9C035 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM5Q9C035 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM5Q9C035 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM5Q9C035 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM5Q9C035 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM5Q9C035 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM5Q9C035 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM5Q9C035 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM5Q9C035 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM5Q9C035 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM5Q9C035 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM5Q9C035 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM5Q9C035 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM5Q9C035 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM5Q9C035 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM5Q9C035 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM5Q9C035 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM5Q9C035 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM5Q9C035 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM5Q9C035 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM5Q9C035 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM5Q9C035 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIM5Q9C035 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIM5Q9C035 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIM5Q9C035 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIM5Q9C035 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIM5Q9C035 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIM5Q9C035 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIM5Q9C035 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIM5Q9C035 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIM5Q9C035 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIM5Q9C035 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIM5Q9C035 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIM5Q9C035 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIM5Q9C035 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIM5Q9C035 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms