Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y8

KRT27, Keratin, type I cytoskeletal 27, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT27Q7Z3Y8 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT27Q7Z3Y8 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT27Q7Z3Y8 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT27Q7Z3Y8 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT27Q7Z3Y8 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT27Q7Z3Y8 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT27Q7Z3Y8 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT27Q7Z3Y8 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT27Q7Z3Y8 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT27Q7Z3Y8 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT27Q7Z3Y8 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT27Q7Z3Y8 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT27Q7Z3Y8 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT27Q7Z3Y8 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT27Q7Z3Y8 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT27Q7Z3Y8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT27Q7Z3Y8 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT27Q7Z3Y8 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT27Q7Z3Y8 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT27Q7Z3Y8 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT27Q7Z3Y8 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT27Q7Z3Y8 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT27Q7Z3Y8 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT27Q7Z3Y8 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT27Q7Z3Y8 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT27Q7Z3Y8 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT27Q7Z3Y8 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT27Q7Z3Y8 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT27Q7Z3Y8 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT27Q7Z3Y8 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT27Q7Z3Y8 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT27Q7Z3Y8 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT27Q7Z3Y8 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT27Q7Z3Y8 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT27Q7Z3Y8 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT27Q7Z3Y8 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT27Q7Z3Y8 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT27Q7Z3Y8 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT27Q7Z3Y8 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT27Q7Z3Y8 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT27Q7Z3Y8 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT27Q7Z3Y8 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT27Q7Z3Y8 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT27Q7Z3Y8 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT27Q7Z3Y8 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT27Q7Z3Y8 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT27Q7Z3Y8 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT27Q7Z3Y8 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT27Q7Z3Y8 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT27Q7Z3Y8 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT27Q7Z3Y8 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT27Q7Z3Y8 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT27Q7Z3Y8 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT27Q7Z3Y8 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT27Q7Z3Y8 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT27Q7Z3Y8 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT27Q7Z3Y8 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT27Q7Z3Y8 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT27Q7Z3Y8 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT27Q7Z3Y8 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT27Q7Z3Y8 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT27Q7Z3Y8 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT27Q7Z3Y8 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT27Q7Z3Y8 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT27Q7Z3Y8 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT27Q7Z3Y8 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT27Q7Z3Y8 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT27Q7Z3Y8 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT27Q7Z3Y8 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT27Q7Z3Y8 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT27Q7Z3Y8 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT27Q7Z3Y8 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT27Q7Z3Y8 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT27Q7Z3Y8 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT27Q7Z3Y8 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT27Q7Z3Y8 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT27Q7Z3Y8 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT27Q7Z3Y8 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT27Q7Z3Y8 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT27Q7Z3Y8 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT27Q7Z3Y8 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT27Q7Z3Y8 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT27Q7Z3Y8 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT27Q7Z3Y8 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT27Q7Z3Y8 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT27Q7Z3Y8 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT27Q7Z3Y8 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT27Q7Z3Y8 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.3 ms