Protein–RNA interactions for Protein: Q5UIP0

RIF1, Telomere-associated protein RIF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIF1Q5UIP0 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RIF1Q5UIP0 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RIF1Q5UIP0 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RIF1Q5UIP0 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RIF1Q5UIP0 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RIF1Q5UIP0 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RIF1Q5UIP0 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RIF1Q5UIP0 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RIF1Q5UIP0 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RIF1Q5UIP0 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RIF1Q5UIP0 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RIF1Q5UIP0 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RIF1Q5UIP0 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RIF1Q5UIP0 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RIF1Q5UIP0 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RIF1Q5UIP0 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
RIF1Q5UIP0 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
RIF1Q5UIP0 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RIF1Q5UIP0 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RIF1Q5UIP0 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RIF1Q5UIP0 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RIF1Q5UIP0 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RIF1Q5UIP0 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RIF1Q5UIP0 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RIF1Q5UIP0 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RIF1Q5UIP0 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RIF1Q5UIP0 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RIF1Q5UIP0 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RIF1Q5UIP0 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RIF1Q5UIP0 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RIF1Q5UIP0 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RIF1Q5UIP0 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RIF1Q5UIP0 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RIF1Q5UIP0 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RIF1Q5UIP0 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RIF1Q5UIP0 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RIF1Q5UIP0 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RIF1Q5UIP0 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RIF1Q5UIP0 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RIF1Q5UIP0 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RIF1Q5UIP0 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RIF1Q5UIP0 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RIF1Q5UIP0 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RIF1Q5UIP0 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RIF1Q5UIP0 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RIF1Q5UIP0 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RIF1Q5UIP0 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RIF1Q5UIP0 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RIF1Q5UIP0 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RIF1Q5UIP0 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RIF1Q5UIP0 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RIF1Q5UIP0 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RIF1Q5UIP0 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RIF1Q5UIP0 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RIF1Q5UIP0 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RIF1Q5UIP0 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RIF1Q5UIP0 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RIF1Q5UIP0 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RIF1Q5UIP0 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RIF1Q5UIP0 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RIF1Q5UIP0 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RIF1Q5UIP0 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RIF1Q5UIP0 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RIF1Q5UIP0 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RIF1Q5UIP0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RIF1Q5UIP0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RIF1Q5UIP0 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RIF1Q5UIP0 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RIF1Q5UIP0 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RIF1Q5UIP0 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
RIF1Q5UIP0 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RIF1Q5UIP0 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RIF1Q5UIP0 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RIF1Q5UIP0 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RIF1Q5UIP0 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
RIF1Q5UIP0 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RIF1Q5UIP0 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RIF1Q5UIP0 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RIF1Q5UIP0 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RIF1Q5UIP0 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RIF1Q5UIP0 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RIF1Q5UIP0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RIF1Q5UIP0 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RIF1Q5UIP0 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RIF1Q5UIP0 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RIF1Q5UIP0 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RIF1Q5UIP0 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RIF1Q5UIP0 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RIF1Q5UIP0 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RIF1Q5UIP0 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RIF1Q5UIP0 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RIF1Q5UIP0 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RIF1Q5UIP0 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RIF1Q5UIP0 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RIF1Q5UIP0 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RIF1Q5UIP0 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RIF1Q5UIP0 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RIF1Q5UIP0 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RIF1Q5UIP0 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RIF1Q5UIP0 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms