Protein–RNA interactions for Protein: Q58FF7

HSP90AB3P, Putative heat shock protein HSP 90-beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB3PQ58FF7 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HSP90AB3PQ58FF7 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HSP90AB3PQ58FF7 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HSP90AB3PQ58FF7 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HSP90AB3PQ58FF7 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HSP90AB3PQ58FF7 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HSP90AB3PQ58FF7 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HSP90AB3PQ58FF7 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HSP90AB3PQ58FF7 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HSP90AB3PQ58FF7 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HSP90AB3PQ58FF7 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HSP90AB3PQ58FF7 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HSP90AB3PQ58FF7 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
HSP90AB3PQ58FF7 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
HSP90AB3PQ58FF7 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HSP90AB3PQ58FF7 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HSP90AB3PQ58FF7 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HSP90AB3PQ58FF7 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HSP90AB3PQ58FF7 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HSP90AB3PQ58FF7 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HSP90AB3PQ58FF7 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HSP90AB3PQ58FF7 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HSP90AB3PQ58FF7 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HSP90AB3PQ58FF7 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HSP90AB3PQ58FF7 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HSP90AB3PQ58FF7 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HSP90AB3PQ58FF7 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HSP90AB3PQ58FF7 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HSP90AB3PQ58FF7 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HSP90AB3PQ58FF7 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HSP90AB3PQ58FF7 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HSP90AB3PQ58FF7 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HSP90AB3PQ58FF7 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HSP90AB3PQ58FF7 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HSP90AB3PQ58FF7 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HSP90AB3PQ58FF7 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HSP90AB3PQ58FF7 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HSP90AB3PQ58FF7 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HSP90AB3PQ58FF7 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HSP90AB3PQ58FF7 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HSP90AB3PQ58FF7 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HSP90AB3PQ58FF7 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HSP90AB3PQ58FF7 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HSP90AB3PQ58FF7 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HSP90AB3PQ58FF7 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HSP90AB3PQ58FF7 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HSP90AB3PQ58FF7 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HSP90AB3PQ58FF7 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HSP90AB3PQ58FF7 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HSP90AB3PQ58FF7 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HSP90AB3PQ58FF7 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HSP90AB3PQ58FF7 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HSP90AB3PQ58FF7 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HSP90AB3PQ58FF7 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HSP90AB3PQ58FF7 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HSP90AB3PQ58FF7 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HSP90AB3PQ58FF7 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HSP90AB3PQ58FF7 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HSP90AB3PQ58FF7 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HSP90AB3PQ58FF7 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HSP90AB3PQ58FF7 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HSP90AB3PQ58FF7 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HSP90AB3PQ58FF7 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HSP90AB3PQ58FF7 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HSP90AB3PQ58FF7 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HSP90AB3PQ58FF7 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HSP90AB3PQ58FF7 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HSP90AB3PQ58FF7 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HSP90AB3PQ58FF7 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HSP90AB3PQ58FF7 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HSP90AB3PQ58FF7 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HSP90AB3PQ58FF7 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HSP90AB3PQ58FF7 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HSP90AB3PQ58FF7 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HSP90AB3PQ58FF7 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HSP90AB3PQ58FF7 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HSP90AB3PQ58FF7 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HSP90AB3PQ58FF7 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HSP90AB3PQ58FF7 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HSP90AB3PQ58FF7 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HSP90AB3PQ58FF7 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HSP90AB3PQ58FF7 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HSP90AB3PQ58FF7 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HSP90AB3PQ58FF7 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HSP90AB3PQ58FF7 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HSP90AB3PQ58FF7 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HSP90AB3PQ58FF7 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HSP90AB3PQ58FF7 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HSP90AB3PQ58FF7 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HSP90AB3PQ58FF7 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HSP90AB3PQ58FF7 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HSP90AB3PQ58FF7 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HSP90AB3PQ58FF7 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HSP90AB3PQ58FF7 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HSP90AB3PQ58FF7 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HSP90AB3PQ58FF7 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HSP90AB3PQ58FF7 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HSP90AB3PQ58FF7 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HSP90AB3PQ58FF7 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HSP90AB3PQ58FF7 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms