Protein–RNA interactions for Protein: Q3KP44

ANKRD55, Ankyrin repeat domain-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD55Q3KP44 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ANKRD55Q3KP44 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ANKRD55Q3KP44 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ANKRD55Q3KP44 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ANKRD55Q3KP44 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ANKRD55Q3KP44 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ANKRD55Q3KP44 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ANKRD55Q3KP44 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ANKRD55Q3KP44 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ANKRD55Q3KP44 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ANKRD55Q3KP44 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
ANKRD55Q3KP44 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ANKRD55Q3KP44 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ANKRD55Q3KP44 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ANKRD55Q3KP44 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ANKRD55Q3KP44 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
ANKRD55Q3KP44 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ANKRD55Q3KP44 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ANKRD55Q3KP44 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ANKRD55Q3KP44 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ANKRD55Q3KP44 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ANKRD55Q3KP44 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ANKRD55Q3KP44 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ANKRD55Q3KP44 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ANKRD55Q3KP44 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ANKRD55Q3KP44 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ANKRD55Q3KP44 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ANKRD55Q3KP44 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ANKRD55Q3KP44 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ANKRD55Q3KP44 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ANKRD55Q3KP44 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ANKRD55Q3KP44 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ANKRD55Q3KP44 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ANKRD55Q3KP44 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ANKRD55Q3KP44 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ANKRD55Q3KP44 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ANKRD55Q3KP44 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ANKRD55Q3KP44 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ANKRD55Q3KP44 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ANKRD55Q3KP44 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ANKRD55Q3KP44 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ANKRD55Q3KP44 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ANKRD55Q3KP44 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ANKRD55Q3KP44 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ANKRD55Q3KP44 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ANKRD55Q3KP44 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ANKRD55Q3KP44 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ANKRD55Q3KP44 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms