Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FXNQ16595 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FXNQ16595 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FXNQ16595 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FXNQ16595 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FXNQ16595 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FXNQ16595 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FXNQ16595 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
FXNQ16595 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
FXNQ16595 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
FXNQ16595 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
FXNQ16595 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
FXNQ16595 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
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FXNQ16595 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
FXNQ16595 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FXNQ16595 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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FXNQ16595 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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FXNQ16595 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FXNQ16595 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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FXNQ16595 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FXNQ16595 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FXNQ16595 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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FXNQ16595 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
FXNQ16595 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FXNQ16595 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FXNQ16595 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FXNQ16595 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FXNQ16595 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
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FXNQ16595 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FXNQ16595 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FXNQ16595 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FXNQ16595 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FXNQ16595 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
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FXNQ16595 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FXNQ16595 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
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FXNQ16595 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FXNQ16595 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FXNQ16595 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FXNQ16595 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FXNQ16595 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FXNQ16595 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
FXNQ16595 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
FXNQ16595 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FXNQ16595 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FXNQ16595 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
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