Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNHIT3Q15649 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNHIT3Q15649 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNHIT3Q15649 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNHIT3Q15649 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNHIT3Q15649 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNHIT3Q15649 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNHIT3Q15649 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNHIT3Q15649 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNHIT3Q15649 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNHIT3Q15649 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNHIT3Q15649 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNHIT3Q15649 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNHIT3Q15649 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNHIT3Q15649 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNHIT3Q15649 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNHIT3Q15649 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNHIT3Q15649 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNHIT3Q15649 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNHIT3Q15649 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNHIT3Q15649 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNHIT3Q15649 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNHIT3Q15649 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNHIT3Q15649 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNHIT3Q15649 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNHIT3Q15649 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNHIT3Q15649 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNHIT3Q15649 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNHIT3Q15649 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNHIT3Q15649 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNHIT3Q15649 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNHIT3Q15649 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNHIT3Q15649 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNHIT3Q15649 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNHIT3Q15649 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNHIT3Q15649 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNHIT3Q15649 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNHIT3Q15649 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNHIT3Q15649 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNHIT3Q15649 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNHIT3Q15649 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNHIT3Q15649 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNHIT3Q15649 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNHIT3Q15649 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNHIT3Q15649 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNHIT3Q15649 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNHIT3Q15649 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNHIT3Q15649 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNHIT3Q15649 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNHIT3Q15649 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNHIT3Q15649 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNHIT3Q15649 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNHIT3Q15649 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNHIT3Q15649 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNHIT3Q15649 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNHIT3Q15649 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNHIT3Q15649 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNHIT3Q15649 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNHIT3Q15649 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNHIT3Q15649 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNHIT3Q15649 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ZNHIT3Q15649 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ZNHIT3Q15649 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ZNHIT3Q15649 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNHIT3Q15649 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNHIT3Q15649 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNHIT3Q15649 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNHIT3Q15649 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNHIT3Q15649 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNHIT3Q15649 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNHIT3Q15649 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNHIT3Q15649 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNHIT3Q15649 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNHIT3Q15649 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNHIT3Q15649 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNHIT3Q15649 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNHIT3Q15649 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNHIT3Q15649 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNHIT3Q15649 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNHIT3Q15649 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNHIT3Q15649 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNHIT3Q15649 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNHIT3Q15649 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNHIT3Q15649 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNHIT3Q15649 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNHIT3Q15649 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNHIT3Q15649 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNHIT3Q15649 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNHIT3Q15649 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNHIT3Q15649 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNHIT3Q15649 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNHIT3Q15649 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNHIT3Q15649 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNHIT3Q15649 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNHIT3Q15649 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNHIT3Q15649 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNHIT3Q15649 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNHIT3Q15649 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNHIT3Q15649 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNHIT3Q15649 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms