Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
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