Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms