Protein–RNA interactions for Protein: P15531

NME1, Nucleoside diphosphate kinase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1P15531 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NME1P15531 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NME1P15531 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NME1P15531 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NME1P15531 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NME1P15531 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NME1P15531 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NME1P15531 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NME1P15531 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NME1P15531 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NME1P15531 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NME1P15531 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NME1P15531 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NME1P15531 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NME1P15531 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NME1P15531 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NME1P15531 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NME1P15531 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NME1P15531 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NME1P15531 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NME1P15531 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NME1P15531 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NME1P15531 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NME1P15531 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NME1P15531 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NME1P15531 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NME1P15531 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NME1P15531 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NME1P15531 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NME1P15531 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NME1P15531 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NME1P15531 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NME1P15531 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NME1P15531 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NME1P15531 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NME1P15531 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NME1P15531 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NME1P15531 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NME1P15531 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NME1P15531 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NME1P15531 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NME1P15531 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NME1P15531 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NME1P15531 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NME1P15531 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NME1P15531 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NME1P15531 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NME1P15531 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NME1P15531 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NME1P15531 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NME1P15531 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NME1P15531 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NME1P15531 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NME1P15531 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NME1P15531 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NME1P15531 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NME1P15531 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NME1P15531 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NME1P15531 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NME1P15531 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NME1P15531 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NME1P15531 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NME1P15531 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NME1P15531 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
NME1P15531 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NME1P15531 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NME1P15531 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NME1P15531 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NME1P15531 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NME1P15531 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NME1P15531 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NME1P15531 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NME1P15531 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NME1P15531 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NME1P15531 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NME1P15531 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NME1P15531 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NME1P15531 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NME1P15531 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NME1P15531 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NME1P15531 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NME1P15531 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NME1P15531 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NME1P15531 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NME1P15531 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NME1P15531 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
NME1P15531 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NME1P15531 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
NME1P15531 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NME1P15531 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NME1P15531 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NME1P15531 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NME1P15531 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NME1P15531 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NME1P15531 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NME1P15531 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NME1P15531 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NME1P15531 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NME1P15531 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NME1P15531 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms